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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001238`

染色体: Chr04 坐标: 19410757-19411689 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001238`
名称	SmilChr04G001238
描述	uncharacterized SmilChr04G001238
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19410757 - 19411689 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023112`
GeneID	`131023112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023112`
原始查询	`SmilChr04G001238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=36.2; qcov=0.223; evalue=2.71e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=30.9; qcov=0.303; evalue=8.27e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808639.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057808639.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808639.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808639.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808639.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19410767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:19410768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C72
`Chr4:19410772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:19410868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B53
`Chr4:19410885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:19410916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:19410955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B43,B79
`Chr4:19410961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,C74,C79,C84
`Chr4:19410963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C36,C74
`Chr4:19410965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B122,B52,B72
`Chr4:19410996`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A23,A3,A4,A9,B10,B11,B114,B115,B127,B128,B13,B2,B23,B34,B41,B75,B86,B88,B91,C1,C19,C2,C21,C22,C32,C34,C42,C52,C54,C56,C64,C7,C74,C76,C87
`Chr4:19411005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B43,B60,B84,C66,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952656.1
ATGGCTCAGCAACAAGTGAAGTTCCAAAGTGAGACCGAAAAATTCATAATGGAGACAAGAGGAGGAATGCAGAATGTGAACTCCCAACTATCACATCTTGCCCAAGCAGTTGCCAGACTTGAAAGCAAACAAGGGACACTTCCGTCCCAAGTGGAGGTGAAGAAGGTGAATGCCATGACGCTCAGAGGAGGAAAGGAACTACCCGAAGTGGTGACAGAGAAAAAACGAGAAGAATCAGAGATTAACGAGCAAGTCGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023112
ATGGCTCAGCAACAAGTGAAGTTCCAAAGTGAGACCGAAAAATTCATAATGGAGACAAGAGGAGGAATGCAGAATGTGAACTCCCAACTATCACATCTTGCCCAAGCAGTTGCCAGACTTGAAAGCAAACAAGGGACACTTCCGTCCCAAGTGGAGGTGAAGAAGGTGAATGCCATGACGCTCAGAGGAGGAAAGGAACTACCCGAAGTGGTGACAGAGAAAAAACGAGAAGAATCAGAGATTAACGAGCAAGTCGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808639.1
MAQQQVKFQSETEKFIMETRGGMQNVNSQLSHLAQAVARLESKQGTLPSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVVTEKKREESEINEQVGMGSADEEELAREKDAKRKAIGKGKEKANQTEPILPFPGRAAKEQEKEELTELVKIFKKVEVNMPLLVALRSMPRCAKFLKELCTRKVKYTDDAKFQVGESVSAVLQRDMPIKCGDPGMFYIPCVIGTMKVEKAMLDLGASINVMPLSMYQDLEIGPLKPTRVVIQLADRSSVYP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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