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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001239`

染色体: Chr04 坐标: 19464505-19469117 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001239`
名称	SmilChr04G001239
描述	NADPH-dependent pterin aldehyde reductase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	19464505 - 19469117 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023696`
GeneID	`131023696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023696`
原始查询	`SmilChr04G001239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NADPH-dependent pterin aldehyde reductase-like
产物	NADPH-dependent pterin aldehyde reductase-like
Arabidopsis	`AT1G10310` (AT1G10310) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837570] identity=66; qcov=1; evalue=3.17e-118; confidence=high
Rice	`Os02g0557700` - identity=68.6; qcov=0.82; evalue=3.06e-107; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006760 (folic acid-containing compound metabolic process); GO:0016616 (oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF01370 (Epimerase); PF03807 (F420_oxidored); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057809247.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809247.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057809247.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057809247.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809247.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:19466927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809247.1

256 aa

128

256

adh_short

Epimerase

adh_short_C2

F420_oxidored

PF00106 adh_short 25-219 aa PF08659 KR 27-200 aa PF01370 Epimerase 27-207 aa PF13561 adh_short_C2 31-222 aa PF03807 F420_oxidored 36-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809247.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	25	219	3.4e-49	167.7	short chain dehydrogenase
`XP_057809247.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	27	200	2.7e-09	37.9	KR domain
`XP_057809247.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	27	207	6.5e-07	29.7	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057809247.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	31	222	1.1e-35	124.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase
`XP_057809247.1`	Pfam	`PF03807`	F420_oxidored	Family	36	71	8.2e-05	23.9	NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953264.1
TTTAATCCTCTTTTCTGCTACCGCTTGAAGAGGCATGAGCACACCTCTACCGCCGCCCGCAGCGAACGCCATGAACATCGTTGCAGGCGCCGCTCCCATTAATCTCAAGAAAGTGCTGATTACGGGGGTGAGCCGCGGCCTCGGTAAAGCCCTAGCACTGGAATTGGCCAAGCGCGGCCACACCGTAATCGGCTGCTCCCGCTCGCCGGAAAAGCTTTCAGCTCTCCAGTCCGAGCTAGCCTCCGCCTCGGACGGCAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023696
ATGAGCACACCTCTACCGCCGCCCGCAGCGAACGCCATGAACATCGTTGCAGGCGCCGCTCCCATTAATCTCAAGAAAGTGCTGATTACGGGGGTGAGCCGCGGCCTCGGTAAAGCCCTAGCACTGGAATTGGCCAAGCGCGGCCACACCGTAATCGGCTGCTCCCGCTCGCCGGAAAAGCTTTCAGCTCTCCAGTCCGAGCTAGCCTCCGCCTCGGACGGCAAGAGCAACGCTGACAAGCACATCTGCATGAATGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809247.1
MSTPLPPPAANAMNIVAGAAPINLKKVLITGVSRGLGKALALELAKRGHTVIGCSRSPEKLSALQSELASASDGKSNADKHICMNVDVRSNRSVEELARAVVAKKAVPDIIVNNAGTINRNNKIWEVPEDEFDTVIDTNIKGTTNVLRNFIPIMIENKHGIIVNMSSGWGRSAAAQVAPYCASKWAVEGLTRSVAKELPPGIAVVALNPGVINTEMLQSCFGTSASLYPTPESWAPRAATLILHLTTADNGAPLTV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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