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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001272`

染色体: Chr04 坐标: 20234331-20235538 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001272`
名称	SmilChr04G001272
描述	expansin-A13
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	20234331 - 20235538 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021077`
GeneID	`131021077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021077`
原始查询	`SmilChr04G001272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A13
产物	expansin-A13
Arabidopsis	`AT3G03220` (EXPA13) expansin A13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821224] identity=79.3; qcov=0.866; evalue=1.26e-141; confidence=high
Rice	`Os04g0583500` (EXPA10) - identity=64.2; qcov=0.916; evalue=1.36e-123; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057806150.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057806150.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057806150.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806150.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:20234712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B119,C57
`Chr4:20234889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:20234901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C2,C35
`Chr4:20235033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr4:20235033`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6
`Chr4:20235100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42
`Chr4:20235186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B42,B43,B76,B95
`Chr4:20235189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B33
`Chr4:20235189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806150.1

262 aa

131

262

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 72-158 aa PF01357 Expansin_C 169-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806150.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	72	158	4.3e-17	62.8	Lytic transglycolase
`XP_057806150.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	169	246	1.2e-26	93.3	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950167.1
TGAAATTTACTAGATCATGATAGTAAGATCATAGTAAATCAATGAGTATAGTATATTTTTCGTAATCAACATTAATAATACAAATAAAGTTTAATAAATTTCCTCATTCCCAAAAATTAGAAACTTTCACTTTATCCAGCTTGAAAAAAAGGAAAAAGCAAATTCGACTCCCACCCCAGCCCAGTGTCTCCACTCAGCTCACCCCGCCGCCGCCCCTCCGCTCTCCACCATCGCCCAATATGCGCCTCATCCTCCTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021077
ATGCGCCTCATCCTCCTCTCCCTCTTCCTCGCGCTCTCACTCTCGTCGGCGCTCCTCGTCAGCTCCCACTACTTCCCCTCCACCCCCTCCGCCGCCTCGCATTCCGACTGGAAGCCCGCCCGCGCGACCTACTACGCCGCCATGGACCCCATCGACGCCGTCGGCGGCGCCTGCGGCTACGGTGACCTCGTGAAAGGTGGCTACGGCAAGGCCACCGCCGCCCTCAGCACCGTCCTCTTCGAGAAAGGCCAGATCTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806150.1
MRLILLSLFLALSLSSALLVSSHYFPSTPSAASHSDWKPARATYYAAMDPIDAVGGACGYGDLVKGGYGKATAALSTVLFEKGQICGACFEIRCVEDLRWCIPGTSIIVTATNFCAPNFGFPADSGGKCNPPNSHFVLPIEAFEKIAIWKASNMPVQYRRIRCRKEGGVRFTIGGAGIFMSVLISNVAGAGDLSAVKIKGSRTGWLPMGRNWGQNWHLNADLKNQPLSFEITSSDGVTLPSYNVAPKNWEFGQSFEGKQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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