当前解析结果
SmilChr04G001288| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001288 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001288 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001288 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 20552891 - 20554033 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023126 |
|---|---|
| GeneID | 131023126 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023126 |
| 原始查询 | SmilChr04G001288 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023126 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808652.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808652.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057808652.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808652.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808652.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:20552912 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr4:20552923 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B140,B52,C64,C81 |
Chr4:20552929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr4:20552945 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr4:20552950 |
CGA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B85,C24,C48,C54,C59,C64 |
Chr4:20552968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B122,B71,D11 |
Chr4:20552977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C74,D6 |
Chr4:20552980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B139,B63,B91,C5 |
Chr4:20552983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B13,C60,D5 |
Chr4:20552995 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B118,B73 |
Chr4:20552999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr4:20553012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 61 | A16,A3,A7,B103,B106,B115,B118,B12,B121,B13,B131,B134,B135,B16,B18,B26,B27,B3,B30,B40,B41,B52,B53,B55,B57,B60,B67,B70,B71,B76,B78,C11,C13,C14,C2,C22,C25,C28,C30,C33,C34,C4,C5,C54,C57,C58,C59,C60,C62,C65,C69,C7,C78,C8,C80,C81,C82,C83,D1,D7,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。