当前解析结果
SmilChr04G001289| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001289 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001289 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001289 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 20566476 - 20567639 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023127 |
|---|---|
| GeneID | 131023127 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023127 |
| 原始查询 | SmilChr04G001289 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023127 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808653.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808653.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057808653.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057808653.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808653.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:20566482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B43,B75,C33 |
Chr4:20566496 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A22,B103,B3,B30,B39,B64,B91,C1,C27,C30,C42,C5,C6 |
Chr4:20566593 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 34 | A10,A14,A8,B10,B104,B11,B117,B124,B131,B132,B136,B38,B48,B62,B69,B7,B83,B87,B9,B94,B96,B98,C11,C17,C20,C29,C3,C43,C46,C50,C60,C68,C74,C83 |
Chr4:20566599 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr4:20566605 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B53,C42 |
Chr4:20566607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B83 |
Chr4:20566635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B26,B67,C21,D11 |
Chr4:20566635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B67,C21,D11 |
Chr4:20566641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B109,B73,C16,C62,D3 |
Chr4:20566641 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B73,C16,C62,D3 |
Chr4:20566659 |
GAC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B108 |
Chr4:20566659 |
GAC |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B108 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。