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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001296`

染色体: Chr04 坐标: 20623243-20625177 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001296`
名称	SmilChr04G001296
描述	protein RETICULATA-RELATED 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	20623243 - 20625177 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021128`
GeneID	`131021128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021128`
原始查询	`SmilChr04G001296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETICULATA-RELATED 1, chloroplastic-like
产物	protein RETICULATA-RELATED 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G24690` (AT5G24690) plant/protein, putative (DUF3411) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832541] identity=60.8; qcov=1; evalue=6.05e-80; confidence=high
Rice	`Os05g0474600` - identity=29.1; qcov=0.361; evalue=7.38e-07; confidence=low
GO	GO:0009706 (chloroplast inner membrane); GO:0099402 (plant organ development)
KEGG	-
Pfam	PF11891 (RETICULATA-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806200.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057806200.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057806200.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806200.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:20624722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806200.1

285 aa

142

285

RETICULATA-like

PF11891 RETICULATA-like 247-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806200.1`	Pfam	`PF11891`	RETICULATA-like	Family	247	282	3.1e-08	34.3	Protein RETICULATA-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950217.1
CCTTAACTTCACCCTCACCCCTAATTTCTTTCTCTCTCTTCTTCTCTCTCCCTTTTCTCCAACTGAGGGAGGAAAGGAAATAGCTCAAGGGGAAAGAAGAATTATCAACCCACGACAACTTCAGCCCTATTCTTCGAATCCACTATACCGCTCAAACCAATTCGGATCACAGAACAAACCCAAACATGTCTCATTCAGTCTTCCAAACGGCACAGATTATGCCCCTCGCGCCAACCTCCAAATCCTTATCTTCCAAGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021128
ATGTCTCATTCAGTCTTCCAAACGGCACAGATTATGCCCCTCGCGCCAACCTCCAAATCCTTATCTTCCAAGCCGTTGCAGCCAATGGCAACCGTTTCCCTGCGTCCAGCATCGCCGCCCTTCTCCGGCAGGCGCCGGATGCGTTATTTTCCTGTCAGGGCTTCATCTTCTGCGTTGGTTGACGGCGATGCTAGTGCGCACCTTGAGCGATGCTTTCAGGCGTCTCCGGATGCTCCGTCTTCGACTCCTTCCAGCTCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806200.1
MSHSVFQTAQIMPLAPTSKSLSSKPLQPMATVSLRPASPPFSGRRRMRYFPVRASSSALVDGDASAHLERCFQASPDAPSSTPSSSVEFGPTMKGGQYGAFGAVTLEKSKLDMSKKETKSSPQIETGGGGGNKGKGLSHGGGDGGDDGGDDDDYFDDFDEGDEGDEGGPFRRRVILEELFDRKFVDAVLNEWQKTIMDLPAGFRQAYEMGMVSSAQLVKFLAINARPTTARFISRSLPHGLSRAFIGRMIADPAFMLRLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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