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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001304`

染色体: Chr04 坐标: 20754127-20755558 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001304`
名称	SmilChr04G001304
描述	basic blue protein-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	20754127 - 20755558 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019361`
GeneID	`131019361`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019361`
原始查询	`SmilChr04G001304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	basic blue protein-like
产物	basic blue protein-like
Arabidopsis	`AT2G02850` (ARPN) plantacyanin [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814816] identity=53.9; qcov=1.04; evalue=2.12e-46; confidence=medium
Rice	`Os03g0709300` (OsUCL9) - identity=54.3; qcov=1.05; evalue=2.82e-47; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019361

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057803874.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057803874.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803874.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803874.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:20754441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:20755293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B40
`Chr4:20755342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C21,D11
`Chr4:20755434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803874.1

123 aa

123

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 38-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803874.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	38	116	4.3e-27	94.7	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947891.1
GGGATATGATTTAAAGCAGAAGAAATTAAGTGCGGTATATCCTTAGACTGATTTTATTTTCTTCTCTTTTATCTTTAGAAAAGAAAACGTGGGCCCTCCCTCATCAAAGCGCCAATACCATCATTTCCCTTGTCTATAAATACAAACAATTCGCAGTTTGATTAATGCCACCACACAATTAGTTCACACATCATATATAGCTAGTGAGTAAGAGAGAGAAGAAGATGGCTAAGGGAAGAGGCAGTGCGATAGTTGTTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019361
ATGGCTAAGGGAAGAGGCAGTGCGATAGTTGTTGCTATGGTGATAATGGGTATGCTTATGCTGCCTCAAGTGGCGGAAGCCGCCTCGTACGTGGTGGGCGGCGCCGGCGGCTGGACCTTCAACGTCGATGCTTGGCCCAAAGGCAAGCGCTTTAAGGCCGGTGATACCCTTGTGTTCAACTACAATTCGGGGATCCACAATATGGTGGCGGTGGACAAGAAGGGCTACGATAGTTGCAGCGCCCCTTCGAGCGCCAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803874.1
MAKGRGSAIVVAMVIMGMLMLPQVAEAASYVVGGAGGWTFNVDAWPKGKRFKAGDTLVFNYNSGIHNMVAVDKKGYDSCSAPSSAKVYQSGKDQIKLKKGQSFFICSIAGHCQSGMKVAVSAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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