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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001314`

染色体: Chr04 坐标: 21002259-21002777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001314`
名称	SmilChr04G001314
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21002259 - 21002777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023134`
GeneID	`131023134`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023134`
原始查询	`SmilChr04G001314`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	secreted RxLR effector protein 161-like
产物	secreted RxLR effector protein 161-like
Arabidopsis	`AT4G23160` (CRK8) cysteine-rich RECEPTOR-like kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828415] identity=37.7; qcov=0.85; evalue=7.48e-19; confidence=low
Rice	`Os08g0125300` - identity=41.1; qcov=0.954; evalue=1.5e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023134

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808662.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808662.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808662.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808662.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808662.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21002265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B120,B14,B45,D7
`Chr4:21002278`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B4,B77,C5,C61,C68,C72,C80,C86,C9,D10,D8
`Chr4:21002280`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	168	A1,A10,A13,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B114,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B129,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B18,B19,B2,B23,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B68,B69,B71,B73,B75,B77,B78,B79,B82,B83,B85,B88,B89,B9,B92,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C10,C11,C12,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C39,C41,C42,C45,C47,C48,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C61,C63,C65,C67,C68,C69,C70,C72,C73,C74,C77,C79,C80,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D6,D8,D9
`Chr4:21002283`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	131	A1,A10,A13,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B110,B111,B114,B117,B119,B12,B120,B126,B128,B131,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B18,B19,B2,B23,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B33,B35,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B54,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B63,B65,B68,B71,B75,B78,B79,B82,B83,B85,B89,B9,B93,B94,B95,B96,B98,B99,C10,C12,C15,C18,C19,C2,C20,C21,C25,C26,C27,C28,C35,C36,C39,C41,C42,C45,C47,C50,C52,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C63,C65,C70,C72,C74,C79,C83,C84,C87,D1,D3,D5,D7,D8
`Chr4:21002288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr4:21002317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C39
`Chr4:21002323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B57,B69,D1
`Chr4:21002351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:21002380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B53
`Chr4:21002380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:21002386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,D11
`Chr4:21002415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952679.1
ATGCAAAACATCCCTTATGCCAATGCCATAGGTTCTGTCATATACATGGCTAATCCTGGAATGCCTCATTGGGAAGCTATTAAATGGTTGTTCAGATATTTGAAATCTACTGTGAATTGTGGTCTCTCTTTTGATAAATCTGATGATGGGGTCAAATGTGTTGGTTATGTTGACTCTAATTATGCTGACAATAAGGATAATAGAAAGTCTACCACTTCCTATGTGTTTACTCTCTGTGGTTCTTGTATTAGCTGGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023134
ATGCAAAACATCCCTTATGCCAATGCCATAGGTTCTGTCATATACATGGCTAATCCTGGAATGCCTCATTGGGAAGCTATTAAATGGTTGTTCAGATATTTGAAATCTACTGTGAATTGTGGTCTCTCTTTTGATAAATCTGATGATGGGGTCAAATGTGTTGGTTATGTTGACTCTAATTATGCTGACAATAAGGATAATAGAAAGTCTACCACTTCCTATGTGTTTACTCTCTGTGGTTCTTGTATTAGCTGGAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808662.1
MQNIPYANAIGSVIYMANPGMPHWEAIKWLFRYLKSTVNCGLSFDKSDDGVKCVGYVDSNYADNKDNRKSTTSYVFTLCGSCISWKSQLQGIVALSTTESEYIAATEAVKKAIWLNGVLSELQHIDDKPLLFSDSQSAIQLCKNPVFMIEQNI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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