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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001317`

染色体: Chr04 坐标: 21104102-21109945 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001317`
名称	SmilChr04G001317
描述	uncharacterized SmilChr04G001317
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21104102 - 21109945 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019370`
GeneID	`131019370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019370`
原始查询	`SmilChr04G001317`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814636]; symbol=AT2G01080; hit=AT2G01080; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814636]; symbol=AT2G01080; hit=AT2G01080; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G01080` (AT2G01080) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814636] identity=73.3; qcov=0.724; evalue=3.14e-83; confidence=high
Rice	`Os03g0262700` - identity=59.6; qcov=1.03; evalue=1.96e-81; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803887.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803887.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803887.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803887.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803887.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21104466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:21104541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:21104602`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr4:21104602`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56
`Chr4:21104604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr4:21104645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr4:21104712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B85,C68,C72,C8
`Chr4:21104853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803887.1

228 aa

114

228

LEA_2

PF03168 LEA_2 105-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803887.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	105	205	6.8e-12	46.4	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947904.1
CTCAAAGCAATCAAATGAATAAATAAGTATACTTTTAAAAGCTAATGTTACACAGACACAGCCACACCGATTCGCTCACATCACATGCGTCTCTCTTTTCCATTTCACGCAAAGATCCTCTCTTGAAAAGCAAGCAACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAAGAAAAGTAGCAAAAGAAGTGGCCACCGCCGTGGGTGGTGGTGGGGCTTAGTACCCTTTCACTATTTCCCCAATTTTTCCCACCAAAACCCAAAAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019370
ATGACCTCTCGAGACATCACCGCCACCGCCGCCGCAAACCACCCTACTTCCGGCGGCAACCACCACCACTACTACCCACCGTCGAATTCGTCATCCTCGTCCTCCGCCTCGTTCCGCGGCTGCTGCTGCTGCCTCTTCCTCCTCTTCTCCTTCCTCGCCCTCCTGGCCCTCGCCGTGGTGCTGGTGGTGGTCCTCGCAGTGAAGCCGAAGAAGCCGGAATTCGACCTCCAGCAGGTGGGCGTGCAGTACATGGGCATCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803887.1
MTSRDITATAAANHPTSGGNHHHYYPPSNSSSSSSASFRGCCCCLFLLFSFLALLALAVVLVVVLAVKPKKPEFDLQQVGVQYMGISPTTASSAAVSLNIRMVFTAANGNKVGIKYGESRFTVMYRGIPLGRGGVPGFYQPAHSVRRIECVIVVDRVSLLQADAADLVRDASLNDRVELRVVGDVGAKIRILGFTSPGVQVSVDCTIAISPRKQALIYKQCGFDGLSV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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