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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr04G001331

染色体: Chr04 坐标: 21509716-21510660 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr04G001331
名称SmilChr04G001331
描述uncharacterized SmilChr04G001331
染色体 / SeqIDChr04 / NC_080390.1
坐标与链方向21509716 - 21510660 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131023139
GeneID131023139
locus_tag-
NCBI NameLOC131023139
原始查询SmilChr04G001331

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131023139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 0.60000 XP_057808669.1
2 Cytoplasm 细胞质 0.60000 XP_057808669.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057808669.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057808669.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057808669.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr4:21509723 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 A15,C66
Chr4:21509738 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B101,B8,B87
Chr4:21509772 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B101,B87
Chr4:21509776 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 A24,B101,B87
Chr4:21509781 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 A7
Chr4:21509785 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 20 A25,A7,B101,B108,B113,B128,B28,B39,B44,B5,B50,B62,C11,C18,C25,C44,C67,C73,C80,C83
Chr4:21509788 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B129,B42,B90,B92
Chr4:21509807 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B6,C56,C65
Chr4:21509825 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 9 A13,A15,B107,B40,B64,B85,B91,B93,C58
Chr4:21509836 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B34,B73,B83,C86,C87
Chr4:21509848 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 12 B102,B104,B11,B4,B67,B75,C21,C46,C51,C62,C63,D8
Chr4:21509850 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A24,B74,B86,C14,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057952686.1
ATGGTCAGAGAAGACAATCCAGCCAATAAGACCCTTCGGGATATGATGTTCCCAAACAATCTGAACCTCCGACCTATGGGCATAGTGTTGCCCAATATCACTGGGAATTGGGAGTTGAAGCACAACCTGATCCAGATATTGCCCAAATACAGTGATATGCCCGGAGAGGACCCTATGCGGCACTTGCAAGATTTCGAGATGGCTTGTGGAACAATCCGCACCGTATCTCCTGCCCTTACTGAGTACATCCGACTCCTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131023139
ATGGTCAGAGAAGACAATCCAGCCAATAAGACCCTTCGGGATATGATGTTCCCAAACAATCTGAACCTCCGACCTATGGGCATAGTGTTGCCCAATATCACTGGGAATTGGGAGTTGAAGCACAACCTGATCCAGATATTGCCCAAATACAGTGATATGCCCGGAGAGGACCCTATGCGGCACTTGCAAGATTTCGAGATGGCTTGTGGAACAATCCGCACCGTATCTCCTGCCCTTACTGAGTACATCCGACTCCTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057808669.1
MVREDNPANKTLRDMMFPNNLNLRPMGIVLPNITGNWELKHNLIQILPKYSDMPGEDPMRHLQDFEMACGTIRTVSPALTEYIRLLTFPFSLQEGARDWLYVLPKSSITTWQQLQQKFLERFFPVSRIQSLRTRISNIKMGDGEILYDYWGRFKQMLAKCPQHQIPAHDLVRYFVGGLRRQERQWLHAACGGSILNKSTAEAFKLIANMAEESRDEEGTIERMSPPEPSSAQDDKIDKLCSALEMFMSNQIPLTKKPVKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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