当前解析结果
SmilChr04G001331| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001331 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001331 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001331 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 21509716 - 21510660 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023139 |
|---|---|
| GeneID | 131023139 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023139 |
| 原始查询 | SmilChr04G001331 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023139 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808669.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808669.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808669.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808669.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808669.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:21509723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,C66 |
Chr4:21509738 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B8,B87 |
Chr4:21509772 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B87 |
Chr4:21509776 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,B101,B87 |
Chr4:21509781 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
Chr4:21509785 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | A25,A7,B101,B108,B113,B128,B28,B39,B44,B5,B50,B62,C11,C18,C25,C44,C67,C73,C80,C83 |
Chr4:21509788 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,B42,B90,B92 |
Chr4:21509807 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B6,C56,C65 |
Chr4:21509825 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | A13,A15,B107,B40,B64,B85,B91,B93,C58 |
Chr4:21509836 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B34,B73,B83,C86,C87 |
Chr4:21509848 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | B102,B104,B11,B4,B67,B75,C21,C46,C51,C62,C63,D8 |
Chr4:21509850 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B74,B86,C14,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。