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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001349`

染色体: Chr04 坐标: 21889271-21894021 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001349`
名称	SmilChr04G001349
描述	tubby-like F-box protein 8
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21889271 - 21894021 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019394`
GeneID	`131019394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019394`
原始查询	`SmilChr04G001349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 8
产物	tubby-like F-box protein 8
Arabidopsis	`AT1G25280` (TLP10) tubby like protein 10 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839112] identity=70; qcov=1.07; evalue=9e-122; confidence=high
Rice	`Os12g0163400` (OsTLP4) - identity=68.7; qcov=1.06; evalue=8.14e-129; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803924.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057803924.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057803922.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803922.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21889480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C23,C85,D10,D11
`Chr4:21889508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C23,C85,D10,D11
`Chr4:21889676`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr4:21889676`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr4:21889678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr4:21889897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C21
`Chr4:21892198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:21892248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803922.1

425 aa

212

425

F-box-like

Tub

PF12937 F-box-like 53-96 aa PF01167 Tub 114-420 aa

XP_057803923.1

425 aa

212

425

F-box-like

Tub

PF12937 F-box-like 53-96 aa PF01167 Tub 114-420 aa

XP_057803924.1

253 aa

126

253

Tub

PF01167 Tub 1-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803922.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	53	96	8e-07	29.5	F-box-like
`XP_057803922.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	114	420	7.5e-108	360.8	Tub family
`XP_057803923.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	53	96	8e-07	29.5	F-box-like
`XP_057803923.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	114	420	7.5e-108	360.8	Tub family
`XP_057803924.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	1	248	5.5e-84	282.6	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947939.1
CGAGTAGTTGCTTGCTAGCTAGCCTGGTATTCGGTCACACAGAGATAGTGGGCAACTATAATAAACCTCATAATTTCAAAGCCAAACGGAAAAACAATAAATTATACATAAGACTTTTTTAATCTTTAAATTAGTTTTTCCACGTTACAATAATTTCACTTTTGTTAATTCAAGGTCGCTATTCTACCTCCGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCCGCTTCTTCGCAGCTTAGATTCATTGCCATCTCAGAGCCGGCTGAGCAG...

XM_057947940.1
TTATACATAAGACTTTTTTAATCTTTAAATTAGTTTTTCCACGTTACAATAATTTCACTTTTGTTAATTCAAGGTCGCTATTCTACCTCCGCTCTCTCTTTCTCTCTCTCCGCTTCTTCGCAGCTTAGATTCATTGCCATCTCAGAGCCGGCTGAGCAGCATCTCTCTCTAGATTGGCACTGTGTGAGAGAAGGTTAATTGCGACGTGTGTGTTTCTGTGTTACTGAAGATCTCTGAAGATACATTGAAATTTTATATTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019394
ATGTCATTCCGAAGTATAGCACGTGATATAAGAGATAGTTTTGGAAGTTTATCACGTCGGAGTTTTGATGTGAGGCTTTCTGGTCATCATAGAGGTAAATCACATGGTTCCTTGCACGACTTGGATGACCAGCCTGTGGTAGTTCAGAATTGTCGCTGGGCCAATCTTCCTCCGGAGCTGCTGTACGATGTAATTAGAAGGTTGGAGGAGAGCGAGAGTACCTGGCCGGCCCGAAAACATGTGGTTGCATGCGCCGCTGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057803922.1
MSFRSIARDIRDSFGSLSRRSFDVRLSGHHRGKSHGSLHDLDDQPVVVQNCRWANLPPELLYDVIRRLEESESTWPARKHVVACAAVCRSWRSMCKEIVKIPELSGKLTFPVSLKQPGSRDGTIQCFIKRDKSNLTYHLFLCLSPALLVENGKFLLSAKRTRRTTCTEYVISMDADNISRSSSTYIGKLRSNFLGTKFIIFDTQPPHNCSHITPPGRTSRRFYSKKVSPKVPTGSYSISQISYELNVLGTRGPRRMNCTM...

XP_057803923.1
MSFRSIARDIRDSFGSLSRRSFDVRLSGHHRGKSHGSLHDLDDQPVVVQNCRWANLPPELLYDVIRRLEESESTWPARKHVVACAAVCRSWRSMCKEIVKIPELSGKLTFPVSLKQPGSRDGTIQCFIKRDKSNLTYHLFLCLSPALLVENGKFLLSAKRTRRTTCTEYVISMDADNISRSSSTYIGKLRSNFLGTKFIIFDTQPPHNCSHITPPGRTSRRFYSKKVSPKVPTGSYSISQISYELNVLGTRGPRRMNCTM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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