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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001350`

染色体: Chr04 坐标: 21904449-21905816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001350`
名称	SmilChr04G001350
描述	coatomer subunit beta'-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21904449 - 21905816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019395`
GeneID	`131019395`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019395`
原始查询	`SmilChr04G001350`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit beta'-2-like
产物	coatomer subunit beta'-2-like
Arabidopsis	`AT1G52360` (AT1G52360) Coatomer, beta' subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841666] identity=91.2; qcov=0.933; evalue=2.38e-77; confidence=high
Rice	`Os02g0209100` - identity=88; qcov=0.933; evalue=1.07e-78; confidence=high
GO	GO:0005198 (structural molecule activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0030117 (membrane coat)
KEGG	-
Pfam	PF04053 (B-prop_COPA_B_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019395

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057803925.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057803925.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057803925.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057803925.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057803925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21905225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A5,B104,C61
`Chr4:21905225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B104,C61
`Chr4:21905590`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A11,A19,A21,A3,A4,A6,B10,B113,B117,B123,B131,B18,B31,B4,B8,B83,B99,C20,C28,C48,C59,C74,C85,C87,D1
`Chr4:21905650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B18,B61,B85
`Chr4:21905685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B37,B85,C50,D6
`Chr4:21905722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B28,B83,C59
`Chr4:21905776`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	B102,B125,B128,B134,B137,B16,B18,B29,B51,B59,B61,B65,B70,B8,B85,C15,C31,C49,C50,C55,C57,C61,C75,D11,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803925.1

134 aa

134

B-prop_COPA_B_2nd

PF04053 B-prop_COPA_B_2nd 24-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803925.1`	Pfam	`PF04053`	B-prop_COPA_B_2nd	Repeat	24	125	2.8e-33	116.2	COPA/B second beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947942.1
ATTGCACATGTGTCGTACCATATTGAGATTAGAGTGCCTAAAAAAGCATTCAGTTAAATTAACTAACCTGCAGGTGACTTTTCCCATTTTTCTCTTTCCACATTCCGTGCATAAGATGCCTCACCTTCGTATCATTTCGCAGACTTGAAAACACATTGAATTATGGCCTTGAAAGAGTTTGGGCAGTTGGCTACATTAAAGGTTCAAGAAGGGTCGTAATCGGTTATGATGAAGGCACGATCATGGTAAAGCTTGGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019395
ATGGTAAAGCTTGGCCGTGAGGTACCTGTTGCTAGTATGGACAATGGAGGGAAAATAATTTGGGCCAAGCATAATGAAATTCAGACTGTCAACATCAAGAGTGTTGGGGCAGATTATGAGGTTGCTGATGGAGAGAGATTACCTTTGGCAGTTAAGGAACTGGGAAATTGCGATCTTTATCCACAGAGCTTAAAGCATAATCCCAATGGTAGGTTTGTTGTTGTATGTGGAGATGGTGAATACATAATATACACAGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803925.1
MVKLGREVPVASMDNGGKIIWAKHNEIQTVNIKSVGADYEVADGERLPLAVKELGNCDLYPQSLKHNPNGRFVVVCGDGEYIIYTALAWRNRSFGSALEFVWSTEGEYAVRESTSKIKIFSKNFQVAFLFILFV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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