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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001353`

染色体: Chr04 坐标: 21992373-21995259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001353`
名称	SmilChr04G001353
描述	UPF0496 protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	21992373 - 21995259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023149`
GeneID	`131023149`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023149`
原始查询	`SmilChr04G001353`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0496 protein 1-like
产物	UPF0496 protein 1-like
Arabidopsis	`AT4G34320` (AT4G34320) transmembrane protein, putative (DUF677) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829582] identity=47.8; qcov=0.818; evalue=4.8e-48; confidence=medium
Rice	`Os03g0199100` - identity=55.4; qcov=0.755; evalue=1.86e-51; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05055 (DUF677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023149

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808678.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808678.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808678.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808678.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:21992407`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	54	A10,A11,A2,A9,B103,B109,B114,B121,B13,B132,B134,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B26,B38,B39,B41,B44,B49,B5,B56,B61,B68,B7,B72,B73,B77,B82,B88,B89,B96,C12,C15,C19,C21,C29,C37,C4,C40,C46,C50,C51,C58,C65,C76,C82,C9,D4,D9
`Chr4:21992409`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C77
`Chr4:21992409`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C77
`Chr4:21992431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B53,B93,C42
`Chr4:21992440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:21992447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:21994712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C75,C79
`Chr4:21994746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B64,C66,C67
`Chr4:21994767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:21994770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B14,C50,C9
`Chr4:21994775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:21994780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808678.1

220 aa

110

220

DUF677

PF05055 DUF677 75-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808678.1`	Pfam	`PF05055`	DUF677	Family	75	218	3.9e-39	135.2	Protein of unknown function (DUF677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952695.1
ATGTGGTTGAGTGTCAAGCCCTCAGTTTTGATTGTCGGGTACCACAGGCAGCTGGATGCCCCTATTACTCCCTCCGTCCCGCTTCAAATGACCTTAAATTTTTCGGTTGCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAGCTCCTCCAATTTTACTTCCGCCGACTCCGATCTGAGCTCATACGAAGCGGCGTGCCGCTCCGACCCCGACCTCCAAAACTTCGACTCGAAGCTCCAGATCCGCACAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023149
ATGTGGTTGAGTGTCAAGCCCTCAGTTTTGATTGTCGGGTACCACAGGCAGCTGGATGCCCCTATTACTCCCTCCGTCCCGCTTCAAATGACCTTAAATTTTTCGGTTGCGCCGGCGGCGGCTGAGCCACCTGCTGCAAATCATGACCTCAGCTCCTCCAATTTTACTTCCGCCGACTCCGATCTGAGCTCATACGAAGCGGCGTGCCGCTCCGACCCCGACCTCCAAAACTTCGACTCGAAGCTCCAGATCCGCACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808678.1
MWLSVKPSVLIVGYHRQLDAPITPSVPLQMTLNFSVAPAAAEPPAANHDLSSSNFTSADSDLSSYEAACRSDPDLQNFDSKLQIRTSRAINSISVVLDVRSLPLDSLREVTEYLLEMNQEVVTIILQNKRDIWKDDEFSDLVVFENCLLTLDFCTTLDSCLKRAARIESIVKVALRKFDDDRANAGRNYSRTLAELRNFSAAEEPFTQEFFKVFARVNAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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