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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001356`

染色体: Chr04 坐标: 22040387-22044182 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001356`
名称	SmilChr04G001356
描述	uncharacterized SmilChr04G001356
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22040387 - 22044182 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019402`
GeneID	`131019402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019402`
原始查询	`SmilChr04G001356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828818]; symbol=AT4G27100; hit=AT4G27100; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828818]; symbol=AT4G27100; hit=AT4G27100; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G27100` (AT4G27100) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828818] identity=70; qcov=0.294; evalue=2.71e-10; confidence=weak
Rice	`Os07g0525400` - identity=80.8; qcov=0.255; evalue=2.62e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803927.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803927.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803927.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057803928.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22042175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B8,B95,C66
`Chr4:22042184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr4:22042194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B112,B39,B40,B9,B98,C21,C28,C76
`Chr4:22042206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B22,B97,C50
`Chr4:22042225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr4:22042231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B83,C19,C77
`Chr4:22042259`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B17,B95,C28,C76
`Chr4:22042259`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B17,B95,C28,C76
`Chr4:22042292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100245.1
GAACCGTTATGTATGAGCGTCTTTAAAAACTGTTATGTATAATTTTTTTTATTAATTTTTTTAAAATAATATTATATTATCTTATATTATATTAAAAAATAACAAATAAATTATTTATCCTAAAATTTGAATTTATTCCTAGATATAGACTTTGAAAAATAAAAAATTCATAACATTTTTTTATTAAAAATCTAAATTAGAAATCTAAATACCAAAAATTGAATATTAAAAGTGAAAAAAAGAAAAAGACAAATCCTTAT...

XR_009100247.1
AATTTATTCCTAGATATAGACTTTGAAAAATAAAAAATTCATAACATTTTTTTATTAAAAATCTAAATTAGAAATCTAAATACCAAAAATTGAATATTAAAAGTGAAAAAAAGAAAAAGACAAATCCTTATTTCTCTTCAAAATTTCCCCCAATCTCTTCAAAAATTTTCTCCAATCCCGCGCTGAATCCAATCCTGTCTCTCGACTCCCTCTCTCCCCTCTCAACTCCGCCGCCGGCGCCGCTGCCCTGCACCGGCCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019402
ATGCCACCGGTCCACCTTTCTCTTTCCATAGAGAGCTCGTTTATGGTGTGTGGAGATCTGAGATCATTACAAGAGACTGAAGCCGCCTTTATTCTTTCACCGTTTTCTAGGGAAAGGATCATTCTGTGTAAATTGGGAAAAATGTGGAAGGACGTAGGAACTCCAGCCGATTCTTACTATCAAGTGCGACCTGACTGCACTGATGTACCCGAAAGCAAGTTTAGAATCAAGATTACTTTCATGAGGAAGAAGGATTTCAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057803927.1
MPPVHLSLSIESSFMVCGDLRSLQETEAAFILSPFSRERIILCKLGKMWKDVGTPADSYYQVRPDCTDVPESKFRIKEFCIGIQLFEASLTPPHITFMRKKDFRKEQLVLEDLVLEYIV

XP_057803928.1
MPPVHLSLSIESSFMVCGDLRSLQETEAAFILSPFSRERIILCKLGKMWKDVGTPADSYYQVRPDCTDVPESKFRIKITFMRKKDFRKEQLVLEDLVLEYIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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