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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001363`

染色体: Chr04 坐标: 22132127-22133183 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001363`
名称	SmilChr04G001363
描述	vacuolar iron transporter homolog 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22132127 - 22133183 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019409`
GeneID	`131019409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019409`
原始查询	`SmilChr04G001363`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar iron transporter homolog 3-like
产物	vacuolar iron transporter homolog 3-like
Arabidopsis	`AT3G43660` (AT3G43660) Vacuolar iron transporter (VIT) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823468] identity=66.5; qcov=0.943; evalue=3.06e-90; confidence=high
Rice	`Os04g0686800` - identity=58.2; qcov=0.972; evalue=2.88e-58; confidence=high
GO	GO:0005381 (iron ion transmembrane transporter activity); GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0006880 (GO:0006880); GO:0016020 (membrane); GO:0030026 (intracellular manganese ion homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF01988 (VIT1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057803936.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057803936.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057803936.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803936.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22132301`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	94	A13,A18,A19,A2,A20,A21,A24,A4,A5,A7,A8,B101,B103,B105,B108,B109,B110,B113,B123,B125,B128,B129,B130,B131,B135,B14,B140,B25,B26,B27,B31,B34,B35,B37,B42,B43,B44,B48,B57,B58,B66,B74,B76,B8,B82,B88,B89,B9,B90,B92,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C19,C2,C23,C26,C27,C30,C32,C37,C4,C40,C41,C43,C48,C52,C54,C55,C56,C58,C62,C68,C69,C74,C79,C80,C81,C83,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D3,D7,D8,D9
`Chr4:22132438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B33,B40
`Chr4:22132465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:22132510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr4:22132574`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B124,B59,B79
`Chr4:22132574`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B124,B59,B79
`Chr4:22132599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:22132728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,D7
`Chr4:22132756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B33,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803936.1

212 aa

106

212

VIT1

PF01988 VIT1 46-118 aa PF01988 VIT1 123-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803936.1`	Pfam	`PF01988`	VIT1	Family	46	118	2.5e-39	136.1	VIT family
`XP_057803936.1`	Pfam	`PF01988`	VIT1	Family	123	208	2.5e-39	136.1	VIT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947953.1
AATTACAAAATCATTTCTATATAAATAACAGCAACTCCATATACACTCCTACTTTATATCCACTCCCCCAAATCAAATTTGAAATTTTCCGAGATGGAGAAACCACAAATTATTGACAACAAAAGGATCTTGCCTAGCAACGATGCCGACATCGAATTAGGGCAAAACGAAGAAGCTGTAGATGTAGAAGTAGAAGCAGTCCACGATTACTCAAAGAGAGCACAATGGCTGAGGGCCGCGGTTTTGGGCGCAAACGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019409
ATGGAGAAACCACAAATTATTGACAACAAAAGGATCTTGCCTAGCAACGATGCCGACATCGAATTAGGGCAAAACGAAGAAGCTGTAGATGTAGAAGTAGAAGCAGTCCACGATTACTCAAAGAGAGCACAATGGCTGAGGGCCGCGGTTTTGGGCGCAAACGACGGCCTCCTATCCACGGCGTCGCTGATGATGGGAATCGGCGCTGTCCGGCACGACGCCAAGACGATGATCCTCACCGGAATCGCCGGCTTGGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803936.1
MEKPQIIDNKRILPSNDADIELGQNEEAVDVEVEAVHDYSKRAQWLRAAVLGANDGLLSTASLMMGIGAVRHDAKTMILTGIAGLVAGACSMAIGEFVSVYSQFDIEVAQIKREQKARASIKRNLPSPLQAAAASAAAFAVGAAVPLLAAAFVGNYNVRLGAVVAAVSVALLGFGWAGAALGRAPPVRSSLRVLLGGWLAMGITFGFTKLIG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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