当前解析结果
SmilChr04G001372| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001372 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001372 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001372 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22316019 - 22316921 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023153 |
|---|---|
| GeneID | 131023153 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023153 |
| 原始查询 | SmilChr04G001372 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01107 (MP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023153 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057808681.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808681.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808681.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808681.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808681.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22316041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B25,C18,C50 |
Chr4:22316043 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr4:22316068 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B67,C21,D11 |
Chr4:22316131 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr4:22316177 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C21 |
Chr4:22316189 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
Chr4:22316243 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B44,C65,C85 |
Chr4:22316297 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr4:22316311 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B25,C18,C50 |
Chr4:22316386 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr4:22316451 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B25,C18,C50 |
Chr4:22316523 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C36,C51 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808681.1PF01107
MP 2-111 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808681.1 |
Pfam | PF01107 |
MP | Family | 2 | 111 | 7.9e-21 | 75.2 | Viral movement protein (MP) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。