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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001381`

染色体: Chr04 坐标: 22403394-22419785 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001381`
名称	SmilChr04G001381
描述	dynamin-like protein ARC5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22403394 - 22419785 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019423`
GeneID	`131019423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019423`
原始查询	`SmilChr04G001381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-like protein ARC5
产物	dynamin-like protein ARC5
Arabidopsis	`AT3G19720` (ARC5) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821509] identity=77.7; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0178700` (ARC5) - identity=72.5; qcov=0.713; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803948.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803948.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057803948.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057803948.1`
5	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057803948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22404763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:22404889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:22404896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:22406074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr4:22406108`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A4,A9,B19,B78,C17,C19,C30,C31,C35,C45,C46,C53,C74
`Chr4:22409330`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B119
`Chr4:22409330`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B119
`Chr4:22409575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:22411031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C58,D10
`Chr4:22412177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:22412183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C16,C62,D3
`Chr4:22412465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803948.1

760 aa

380

760

Dynamin_N

PF00350 Dynamin_N 46-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803948.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	46	227	9.5e-33	114.3	Dynamin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947965.1
TAATGTACGTACTAATAGGGTTAGATATCGAAGTTTGGATTTTCGAAAGCGAGCGCGCGAGGTGGAGAGCTCCAAAAATCCAAAAAAAAAAAAGCTCCAAAACCGATTTCAGATAGAAACTCTCACCACAGTCACTCAAAACATGGCCGACTCCCTCACACAATTCACCAATGGCGGCGGCGCCGAAGCCGAAGATGGCAACTGGAAGCTGTACGAGGCCTACAACGAGCTTCACGGCCTCGCCCAGGAGTTCTCGACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019423
ATGGCCGACTCCCTCACACAATTCACCAATGGCGGCGGCGCCGAAGCCGAAGATGGCAACTGGAAGCTGTACGAGGCCTACAACGAGCTTCACGGCCTCGCCCAGGAGTTCTCGACGCCTTTCGACGCGCCGGCGGTGCTGGTGGTCGGCCACCAGACCGACGGGAAGAGCGCCCTCGTCGAGGCGCTGATGGGCTTCCAGTTCAACCACGTCGGCGGCGGCACCAAGACCCGCCGCCCCATCACCCTCCACATGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803948.1
MADSLTQFTNGGGAEAEDGNWKLYEAYNELHGLAQEFSTPFDAPAVLVVGHQTDGKSALVEALMGFQFNHVGGGTKTRRPITLHMKFNPSCHAPLCHLLSDSDPSIPQDKSLQEIQAYIEAENMRLERESYQFSSKEIIIRIEYKYCPNLTIIDTPGLIAPAPARKNRALQSQARAVESLVRAKMQHKEFIILCLEDCSDWSNATTRRVVMQIDPELSRTVVVSTKLDTKIPQFARSSDVEVFLSPPASTLDGFMLGDSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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