当前解析结果
SmilChr04G001390| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001390 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001390 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001390 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22601127 - 22602015 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019432 |
|---|---|
| GeneID | 131019432 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019432 |
| 原始查询 | SmilChr04G001390 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019432 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803955.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057803955.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803955.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803955.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803955.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22601303 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B69,C35,C5 |
Chr4:22601303 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B69,C35,C5 |
Chr4:22601306 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 25 | A6,B120,B131,B14,B140,B17,B19,B22,B25,B45,B52,B54,B70,B73,B93,B95,C14,C24,C58,C68,C7,C73,C82,C84,C85 |
Chr4:22601327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B85,B88,C29 |
Chr4:22601660 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,B131 |
Chr4:22601662 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr4:22601665 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A13,A4,B10,B100,B109,B135,B138,B46,B69,B8,B85,C55,C82,D9 |
Chr4:22601666 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B5,B50,B52,B84,C79 |
Chr4:22601667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B75,C11,D8 |
Chr4:22601672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr4:22601677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A13,B106,B21,B31,B61,B92,C11,C13,C23,C47,C60,C61 |
Chr4:22601680 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B75,C11,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。