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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001391`

染色体: Chr04 坐标: 22608071-22614622 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001391`
名称	SmilChr04G001391
描述	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22608071 - 22614622 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019433`
GeneID	`131019433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019433`
原始查询	`SmilChr04G001391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
产物	BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like
Arabidopsis	`AT4G33430` (BAK1) BRI1-associated receptor kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829480] identity=84.6; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0174700` (BAK1) - identity=79; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057803956.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803956.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803956.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803956.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22609207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B42,B43,C41
`Chr4:22609366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:22611800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr4:22613033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B108
`Chr4:22613869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:22614106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:22614204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803956.1

612 aa

306

612

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 25-64 aa PF00560 LRR_1 92-114 aa PF00560 LRR_1 116-138 aa PF00560 LRR_1 140-160 aa PF00560 LRR_1 165-180 aa PF00069 Pkinase 289-559 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 291-562 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	25	64	3.2e-11	44.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	92	114	1.5e-13	48.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	116	138	1.5e-13	48.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	140	160	1.5e-13	48.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	165	180	1.5e-13	48.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	289	559	6.2e-43	147.8	Protein kinase domain
`XP_057803956.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	291	562	4.4e-44	151.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947973.1
CAGCTCAAATATTATACTGGAAAAAAATATCAGATTCCACTAACAAAGTAAAAGCAACACAAAAAAACAATAGAAAATCTCTCCCATTCTTTTTGCTCTCTTTCTCCAGCTCCTTGCATTTTCCCAAATTCAACTCCTTAATCTTGCATCGCTGCTTTTCGTTTCTGCACCTGCTTTTCTTATTATTGATTTTCCTGATTTCAGCTCTTGCACCTTTTGTTGGTGGTTTGGTTCACCGCATTCTGTTGAGTTTATGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019433
ATGGATCGGTCGGTAGCAGCGATCTTGTGCTGCGTTATTACTGTATTCGCGAGGTTTTTGCGAGTTTCTTCCAACGCTGAAGGTGATGCTTTGAATTCTCTGAAGAGCAATTTGGCGGATCCTGAGAATGTTCTTCAGAGTTGGGATCCGACCCTTGTCAATCCTTGCACTTGGTTTCACGTCACATGCAATAGCGAGAATAGTGTTACTCGCGTTGATCTTGGCAATGCAAATTTGTCAGGCCAACTGGTTCCACAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803956.1
MDRSVAAILCCVITVFARFLRVSSNAEGDALNSLKSNLADPENVLQSWDPTLVNPCTWFHVTCNSENSVTRVDLGNANLSGQLVPQLGQLSNLQYLELYSNNISGRIPSELGNLTNLVSLDLYLNSLTGSVPDTLGKLQRLRFLRLNNNSLGGEIPNSLTTIFTLQVLDLSNNKLTGKIPINGSFQLFTPISFSNNLLEQLPVSPPPPVPQNNPSSRVGNSATGAIAGGVAAGAALLFAAPAIALAWYRRRKPQDHFFDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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