当前解析结果
SmilChr04G001393| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001393 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001393 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001393 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 22661863 - 22663866 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023161 |
|---|---|
| GeneID | 131023161 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023161 |
| 原始查询 | SmilChr04G001393 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023161 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808688.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.80000 | XP_057808688.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057808688.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057808688.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808688.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:22661866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B53,C16,D3 |
Chr4:22661867 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C27,D4 |
Chr4:22661869 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 9 | A24,A25,B11,B115,B126,B2,B80,C13,C18 |
Chr4:22661875 |
TCC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B118 |
Chr4:22661875 |
TCC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr4:22661885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
Chr4:22661889 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A13,B125,B25,B31,B43,B82,B88,C10,C13,C41,C65 |
Chr4:22661899 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,C13 |
Chr4:22661908 |
AC |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B111,B91,C2,C29 |
Chr4:22661911 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B59,C79,C81 |
Chr4:22661915 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 8 | B67,B70,B77,B91,C47,C62,C73,C75 |
Chr4:22661921 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,C47 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。