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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001398`

染色体: Chr04 坐标: 22773359-22773987 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001398`
名称	SmilChr04G001398
描述	uncharacterized SmilChr04G001398
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22773359 - 22773987 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019437`
GeneID	`131019437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019437`
原始查询	`SmilChr04G001398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803966.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803966.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803966.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803966.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22773410`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	B2,C13,C23,C38,C44,C61,C82,C87
`Chr4:22773413`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	105	A1,A13,A14,A16,A18,A21,A24,A3,A5,A8,B10,B101,B102,B105,B109,B11,B113,B114,B115,B117,B118,B121,B124,B126,B127,B130,B135,B136,B14,B20,B25,B26,B30,B36,B37,B38,B4,B41,B46,B48,B50,B53,B54,B60,B62,B67,B7,B70,B71,B72,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B89,B91,B93,B97,B99,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C25,C27,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C38,C40,C42,C48,C50,C52,C54,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C68,C69,C72,C74,C79,C8,C81,C83,C84,C9,D3,D8,D9
`Chr4:22773470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:22773506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:22773508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,B64,B79
`Chr4:22773521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:22773541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B24,C2
`Chr4:22773553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C74
`Chr4:22773554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B22,B58,B66
`Chr4:22773571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B22,B58,B66,D10
`Chr4:22773579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A21,B124,B64,B79
`Chr4:22773579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,B64,B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947983.1
CCTCGGTTCATGGACCAATACAGATATCCGCGAGTTGATCAAAATGTTTCATTATAGAACCAACGCCGTAGACAAAGATATGTCGGACCCTAAGGAAATAGAATCGTGCTTGGCTACATTCACTCTTACACGGTTTCGCAGGACTCACGGCGAAATTCTGGGGAAAATAAGGCATTTCATCAGGATGTACAATAGGTTCGTCTCCTTTATTTCCCAAACCCAGATCACCTACAACGTCGAGTCCAATCTCGTTCATATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019437
ATGTTTCATTATAGAACCAACGCCGTAGACAAAGATATGTCGGACCCTAAGGAAATAGAATCGTGCTTGGCTACATTCACTCTTACACGGTTTCGCAGGACTCACGGCGAAATTCTGGGGAAAATAAGGCATTTCATCAGGATGTACAATAGGTTCGTCTCCTTTATTTCCCAAACCCAGATCACCTACAACGTCGAGTCCAATCTCGTTCATATCCAAGGAAACTACAACTACAATAGGGAGACAATGCAGAAAACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803966.1
MFHYRTNAVDKDMSDPKEIESCLATFTLTRFRRTHGEILGKIRHFIRMYNRFVSFISQTQITYNVESNLVHIQGNYNYNRETMQKTRFRLDRFEHYEAMKEVLDGSAIESVAWGSILGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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