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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001399`

染色体: Chr04 坐标: 22775380-22775859 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001399`
名称	SmilChr04G001399
描述	uncharacterized SmilChr04G001399
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22775380 - 22775859 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023164`
GeneID	`131023164`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023164`
原始查询	`SmilChr04G001399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824536]; symbol=AT3G53690; hit=AT3G53690; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824536]; symbol=AT3G53690; hit=AT3G53690; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G53690` (AT3G53690) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824536] identity=26.7; qcov=1.23; evalue=7.89e-06; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023164

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808692.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808692.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808692.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808692.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22775447`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	B110,B125,B31,B42,B43,B88,B90,B92,B98,C10,C15,C80,C87
`Chr4:22775486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B104
`Chr4:22775492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B104
`Chr4:22775527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:22775532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C2
`Chr4:22775537`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	169	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B108,B11,B111,B115,B117,B118,B12,B121,B124,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B135,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B30,B35,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B58,B60,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B91,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C11,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C49,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C65,C68,C69,C70,C72,C74,C75,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C86,C9,D11,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr4:22775561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr4:22775594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B77,C25,C34,C83,D8
`Chr4:22775614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:22775654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952709.1
ATGGCGACAGAAATTCTTAAAATTGCAGACGACGATGACGACGTCTCCATCCTCTACTCCACGCCGCCTCCCTTCAAGAGCGGCGCCACCAAATCGGACGCCATCTCCGTCGATGACTATCGCACGCGCAACGCCAAAATCATAATCGACCTATCTCAATTGGACGACGTCGTCGAAATCCCCGCCTCCTCCTACACCAAGCGGAGGCGCTTCTACAAGGGCGAGTCTTCCAACTCGAAGCGCGACGACGCCGTTCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023164
ATGGCGACAGAAATTCTTAAAATTGCAGACGACGATGACGACGTCTCCATCCTCTACTCCACGCCGCCTCCCTTCAAGAGCGGCGCCACCAAATCGGACGCCATCTCCGTCGATGACTATCGCACGCGCAACGCCAAAATCATAATCGACCTATCTCAATTGGACGACGTCGTCGAAATCCCCGCCTCCTCCTACACCAAGCGGAGGCGCTTCTACAAGGGCGAGTCTTCCAACTCGAAGCGCGACGACGCCGTTCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808692.1
MATEILKIADDDDDVSILYSTPPPFKSGATKSDAISVDDYRTRNAKIIIDLSQLDDVVEIPASSYTKRRRFYKGESSNSKRDDAVLRLSFTCETCADEKPVSDSFRVSSAAITSTARGACRITWRRGCRITSAPWAAPASWSGALILGAEKFYCPYKEC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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