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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001403`

染色体: Chr04 坐标: 22839866-22841266 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001403`
名称	SmilChr04G001403
描述	uncharacterized SmilChr04G001403
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22839866 - 22841266 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023165`
GeneID	`131023165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023165`
原始查询	`SmilChr04G001403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=27.4; qcov=0.837; evalue=1.09e-23; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=25.6; qcov=0.762; evalue=5.79e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808693.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808693.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808693.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808693.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808693.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22839893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B66,C80,D5
`Chr4:22839914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:22839930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B53,C11,C42,C69
`Chr4:22839932`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A15,B104,B11,B120,B137,B26,B28,B38,B39,B50,B67,B9,C14,C15,C22,C25,C26,C34,C4,C42,C6,C63,C79,C83,D2
`Chr4:22839936`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A15,B104,B11,B120,B137,B26,B28,B38,B39,B50,B67,B9,C14,C22,C25,C26,C34,C4,C42,C6,C63,C79,C83,D2
`Chr4:22839976`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A16,B103,B12,B34,B69,B96,C30,C39
`Chr4:22840005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B58,B59,B63,C85
`Chr4:22840005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B59,B63,C85
`Chr4:22840017`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A15,A18,A8,A9,B123,B138,B22,B23,B27,B29,B32,B36,B41,B42,B50,B51,B54,B57,B60,B62,B65,B66,B68,B78,B90,B99,C10,C12,C14,C15,C18,C24,C29,C33,C42,C5,C58,C62,C79,C9,D2
`Chr4:22840024`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A15,A8,A9,B123,B138,B22,B23,B27,B29,B32,B36,B41,B42,B50,B51,B54,B57,B60,B62,B65,B68,B78,B90,B95,B99,C10,C12,C14,C15,C18,C24,C29,C33,C42,C5,C58,C62,C79,C9,D2
`Chr4:22840031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:22840036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B59,B63,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952710.1
ATGAATGTGCTCTCTTGGAATATCAGAGGCATTAGTTCTGCTATGCCTCTTCTTTTCCATTGCTGCAGTACATACAGATCGAGCTTTCTCGGTATTTTGGAGCCTAAGACTCATTTCTCTGGTATTTTGAGTTCTTATTGGCGCTCTTTCAACTTCTCTCCTGTTCATCAGAATGATCGTGGGAGGCGTTCGTCTAACATCTGGTTTTTTGCTGATCATTCTTTATCTCCAGATGTGCTTTTCTCCTCTGACCAGGTGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023165
ATGAATGTGCTCTCTTGGAATATCAGAGGCATTAGTTCTGCTATGCCTCTTCTTTTCCATTGCTGCAGTACATACAGATCGAGCTTTCTCGGTATTTTGGAGCCTAAGACTCATTTCTCTGGTATTTTGAGTTCTTATTGGCGCTCTTTCAACTTCTCTCCTGTTCATCAGAATGATCGTGGGAGGCGTTCGTCTAACATCTGGTTTTTTGCTGATCATTCTTTATCTCCAGATGTGCTTTTCTCCTCTGACCAGGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808693.1
MNVLSWNIRGISSAMPLLFHCCSTYRSSFLGILEPKTHFSGILSSYWRSFNFSPVHQNDRGRRSSNIWFFADHSLSPDVLFSSDQVVVIRCVIMGIDTTLAFTHASCNYIERRQLWLDIKPFIAGSFLMIGDFNSILGAHGRRGRRVPASTPCSEFHTFIENHDLIQPESSGPFFTWTDRRRFPSPIESILDRVLFSQNFSDIWFFSSILVLPRLGSDHSSIMLRCQDTASAPVCRRFRFLNMWCSHEDFLDQVRASWNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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