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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001404`

染色体: Chr04 坐标: 22863697-22865420 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001404`
名称	SmilChr04G001404
描述	uncharacterized SmilChr04G001404
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22863697 - 22865420 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019442`
GeneID	`131019442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019442`
原始查询	`SmilChr04G001404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22; qcov=0.974; evalue=7.9e-16; confidence=weak
Rice	`Os09g0268600` - identity=32.8; qcov=0.945; evalue=3.24e-46; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803971.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803971.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803971.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803971.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803971.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22864270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A21
`Chr4:22864270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:22864357`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A1,A10,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B124,B126,B127,B129,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B31,B33,B35,B36,B37,B40,B41,B44,B47,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B62,B63,B65,B68,B69,B71,B72,B73,B76,B79,B82,B86,B88,B9,B91,B94,B96,B97,C10,C12,C13,C16,C18,C19,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C35,C37,C38,C39,C4,C42,C44,C46,C47,C49,C5,C53,C55,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C7,C70,C71,C77,C78,C79,C82,C84,C9,D1,D2,D3,D4,D6,D9
`Chr4:22864403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:22864475`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	136	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B102,B103,B105,B106,B107,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B12,B120,B124,B126,B127,B129,B132,B133,B134,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B31,B33,B35,B36,B40,B41,B44,B47,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B59,B60,B61,B62,B63,B65,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B76,B79,B8,B82,B86,B88,B9,B91,B94,B96,B97,C10,C12,C13,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C35,C38,C39,C4,C42,C44,C46,C49,C5,C53,C55,C58,C59,C61,C62,C64,C65,C66,C7,C70,C71,C77,C78,C79,C82,C84,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D6,D9
`Chr4:22864511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:22864516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C37,D7
`Chr4:22864537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:22864555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B82
`Chr4:22864564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A10,A11,A15,A4,A7,B106,B11,B115,B126,B127,B14,B24,B38,B39,B40,B44,B48,B49,B56,B59,B63,B67,B73,B74,B78,B89,B95,B96,B97,B99,C13,C14,C19,C24,C27,C3,C45,C56,C59,C62,C65,C71,C73,C83,C84,D11
`Chr4:22864631`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	124	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A2,A20,A23,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B103,B104,B106,B107,B11,B112,B115,B12,B121,B122,B126,B127,B13,B131,B135,B14,B140,B16,B18,B19,B22,B24,B26,B28,B3,B32,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B48,B49,B50,B53,B56,B59,B60,B63,B66,B67,B68,B7,B73,B74,B77,B78,B8,B84,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C11,C13,C14,C15,C19,C2,C22,C24,C27,C3,C32,C37,C4,C41,C45,C47,C49,C53,C56,C58,C59,C61,C62,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D2,D6,D7,D8
`Chr4:22864644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,D11,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803971.1

271 aa

136

271

SWIM

PF04434 SWIM 121-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803971.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	121	156	1.1e-06	28.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947988.1
TTAACATTGATGGAATTTTTACATTTACTAATTAGAATTCATTAGTTACCAAGTAGCTTTCTTTGAACATATTTTCCCTGATTATGTGTGATTAATGCATTGATGGAGTTTTCTAATATTTCTATACACAGGGGTTGATTAATGCAGTCCACACCCTAGCGCCAAATGCTGAGCACCGACATTGTGCTCGTCATATCTATGCAAATTGGAAGAAAAAATGGCCAGGGGTGAAGTTTCAAATCCTTTTCTGGAATATAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019442
ATGTCCGAGTATAATGCACAATTGGCTGCACTGAGGGCAGAATCCAGCGATGCGGCTGAGGACTTTTTGATTCAAAATCCTAAGAGTTTTTGTAAGTCTCACATCAACTCTTACAACAAGTTGGACATTGTCGATAACAATATATGTGAATCTTTTAATAGCTACATACTTAAGTTCAGGGATAGTCCTTTGATTGACATGCTTGATGGGATAAGGTTGTTACTAATGAGAAGGTTATATGATTTGCATAAACTTTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803971.1
MSEYNAQLAALRAESSDAAEDFLIQNPKSFCKSHINSYNKLDIVDNNICESFNSYILKFRDSPLIDMLDGIRLLLMRRLYDLHKLSEGRRDVLCPNIRIKLEHDLNEIKHCDVAPAVGGKYEVQKYNDTHIVDLVEKVCSCRYWELTGLPCFHALACIVHCREDYANFVDVFYHSSNWESCYKNGLQPIQGEKEWPLVNEPPVLPPQYQKQPGRPKKVRKRGHDEPKKVGELYLSRKRKVKMSCSKCGGSDHNVRTCKAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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