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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001405`

染色体: Chr04 坐标: 22865788-22866642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001405`
名称	SmilChr04G001405
描述	uncharacterized SmilChr04G001405
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22865788 - 22866642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023167`
GeneID	`131023167`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023167`
原始查询	`SmilChr04G001405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=30.3; qcov=0.94; evalue=7.36e-37; confidence=low
Rice	`Os02g0508500` - identity=34.6; qcov=0.894; evalue=2.87e-47; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023167

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808694.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808694.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808694.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808694.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22865818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B56,B76,B96,D7
`Chr4:22865818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B76,B96,D7
`Chr4:22865828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B76,B96,D7
`Chr4:22865870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B100,B41,B46,C4,C70,C8
`Chr4:22865876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C47,C7
`Chr4:22865876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C7
`Chr4:22865878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:22865890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:22865966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:22866045`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C31,C6
`Chr4:22866078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B51,C41
`Chr4:22866090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808694.1

284 aa

142

284

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 17-78 aa PF10551 MULE 213-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808694.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	17	78	1.5e-11	44.5	MuDR family transposase
`XP_057808694.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	213	265	1.1e-08	36.0	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952711.1
ATGGAAAAAAAGTTGCAATACGACAAGGATTGTGATCCTAAGACTCTAAAATTGCAACTTGGCATGCGATTCGCTGATGTAGCAGAATGCAAGGAGACGGTGAAGTTGTGGGCGATTGTGAATGGGCATAACATAAAATGGGTAAAATCTGAAGCCTACAGAATACAAGCAAAATGTGAGGCAGGTTGCCCATGGAATTTGTATGCTAGCAAATTGACTCGTGAGCCAACATGTGTTATCAAGAAATATGTCGGGAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023167
ATGGAAAAAAAGTTGCAATACGACAAGGATTGTGATCCTAAGACTCTAAAATTGCAACTTGGCATGCGATTCGCTGATGTAGCAGAATGCAAGGAGACGGTGAAGTTGTGGGCGATTGTGAATGGGCATAACATAAAATGGGTAAAATCTGAAGCCTACAGAATACAAGCAAAATGTGAGGCAGGTTGCCCATGGAATTTGTATGCTAGCAAATTGACTCGTGAGCCAACATGTGTTATCAAGAAATATGTCGGGAAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808694.1
MEKKLQYDKDCDPKTLKLQLGMRFADVAECKETVKLWAIVNGHNIKWVKSEAYRIQAKCEAGCPWNLYASKLTREPTCVIKKYVGKHECVRPIYNRQVTSAWIADRFLEHLKTNPMLKALELQRELRKKYQVRAPLLKCYRAKKKAMDILHGTLEDHYAKIRSYLMELQKRDREGTFLLKTYLNHEEKPVFQRVYLGFSALRKGFFIGCRRFISFDACFLKTTIGGALLATISKDCNHKMYPLAWAVVEKENEETWMWFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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