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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001410`

染色体: Chr04 坐标: 22943124-22943935 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001410`
名称	SmilChr04G001410
描述	uncharacterized SmilChr04G001410
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	22943124 - 22943935 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019445`
GeneID	`131019445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019445`
原始查询	`SmilChr04G001410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803976.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803976.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803976.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803976.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:22943275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C59,C81
`Chr4:22943282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B97
`Chr4:22943354`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A15,A23,A24,B102,B105,B106,B107,B109,B113,B119,B120,B123,B17,B28,B33,B34,B36,B37,B48,B52,B53,B58,B72,B74,B80,B81,B86,B89,B95,C25,C28,C29,C30,C34,C38,C49,C55,C63,C67,C74,C76,C78,C79,C8,C83,C84,D5,D7
`Chr4:22943370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C46,D2,D4,D8
`Chr4:22943386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C7,C71
`Chr4:22943392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B36,C83
`Chr4:22943401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B52,B64,C45
`Chr4:22943401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B64,C45
`Chr4:22943407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A11,A13,A5,B110,B120,B13,B22,B25,B26,B59,B74,B78,C28,C35,C48,C51,C68
`Chr4:22943409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C83
`Chr4:22943419`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B98,C48,C7,C71
`Chr4:22943419`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B98,C48,C7,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803976.1

130 aa

130

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 2-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803976.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	2	92	1.3e-07	32.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947993.1
TGATTGTTGAGATGATAGTTCAGAAATGAACGTAATCATGCCTTTTCAAAAATTGTCTTTTAATGTTTAGTATTGTTCCTTTGTAGAAAATCAGCAATAGGAATAAAGAGAATAGATCAAAGTTACAGATGAATCATGCATGCAGAACAAAATCTATTGCACAGTTTTGCTACGAAGAGCGTGACAATGAAACTGGAGAGGAGCCTAGTCGCACAACTGCATGGAGATTGAGCCGTTATAGTAACACGAAAAAAGACTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019445
ATGAATCATGCATGCAGAACAAAATCTATTGCACAGTTTTGCTACGAAGAGCGTGACAATGAAACTGGAGAGGAGCCTAGTCGCACAACTGCATGGAGATTGAGCCGTTATAGTAACACGAAAAAAGACTGGATCGATGAGGCCTCAAAGGAAGTTTATGATGAGCTTATGAAGTTGCAAGCAGAAGACATTGAAGATCCTATGTCAGAAGATGAAGCTTTTGTCAAGGTTCTTGGTGAGGAAAAATCGAGCCGACTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803976.1
MNHACRTKSIAQFCYEERDNETGEEPSRTTAWRLSRYSNTKKDWIDEASKEVYDELMKLQAEDIEDPMSEDEAFVKVLGEEKSSRLQGCGDGLKPPSKRGERINLDLQKENEELKKKNEELASRFESLEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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