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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001415`

染色体: Chr04 坐标: 23009713-23015279 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001415`
名称	SmilChr04G001415
描述	protein LNK1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	23009713 - 23015279 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019450`
GeneID	`131019450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019450`
原始查询	`SmilChr04G001415`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LNK1-like
产物	protein LNK1-like
Arabidopsis	`AT5G64170` (AT5G64170) dentin sialophosphoprotein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836538] identity=30.8; qcov=0.459; evalue=1.17e-15; confidence=low
Rice	`Os03g0387900` - identity=40; qcov=0.129; evalue=7.74e-07; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0007623 (circadian rhythm)
KEGG	-
Pfam	PF30476 (LNK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803981.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803981.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803981.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803981.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803981.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:23011726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B104,B119
`Chr4:23011841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B58,B66
`Chr4:23011881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:23011948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:23012137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:23012815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:23012819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:23012825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B58,B66
`Chr4:23012837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr4:23012907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:23013175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:23013304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B104,B119,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803981.1

659 aa

330

659

LNK

PF30476 LNK 528-612 aa

XP_057803982.1

659 aa

330

659

LNK

PF30476 LNK 528-612 aa

XP_057803983.1

659 aa

330

659

LNK

PF30476 LNK 528-612 aa

XP_057803984.1

659 aa

330

659

LNK

PF30476 LNK 528-612 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803981.1`	Pfam	`PF30476`	LNK	Domain	528	612	9.7e-33	113.4	LNK
`XP_057803982.1`	Pfam	`PF30476`	LNK	Domain	528	612	9.7e-33	113.4	LNK
`XP_057803983.1`	Pfam	`PF30476`	LNK	Domain	528	612	9.7e-33	113.4	LNK
`XP_057803984.1`	Pfam	`PF30476`	LNK	Domain	528	612	9.7e-33	113.4	LNK

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948000.1
CTCTTCCCTGCCAGAGCTCATTCATTCGCCCTTTTCTCTCTCTCTAGAACCTCCCAGATTTGCGACTCCGGATTCTCGTTTGCTAGGGTTTGTGGCTGGACTCAGCTCTCAGCTTTTGCTGCGGTGTTCTTGCTTCCTATTGGTTTTTCCGGTGAGTTTTATGAAGAGCTCCGGTTAGAAGAGATCAGCTATTCGTGAATAAACATGAAGAAAACTGCATATAGCTTCAGTGCTGGTTAAAATACTCTTAAGGAATGACA...

XM_057947998.1
CTCTTCCCTGCCAGAGCTCATTCATTCGCCCTTTTCTCTCTCTCTAGAACCTCCCAGATTTGCGACTCCGGATTCTCGTTTGCTAGGGTTTGTGGCTGGACTCAGCTCTCAGCTTTTGCTGCGGTGTTCTTGCTTCCTATTGGTTTTTCCGGTGAGTTTTATGAAGAGCTCCGGTTAGAAGAGATCAGCTGTGAAAGAAGATTCGTGAATAAACATGAAGAAAACTGCATATAGCTTCAGTGCTGGTTAAAATACTCTTA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131019450
ATGACAGATTTGCTCATGTATGAGTTTGAAGACATAGGTTGGGATGATCTTTGTCAGAGTGATGACCATATAGTGCCTCGTCCTTTGGAAGATCATTCTCTCCTGCGTGATAGCTGCAAGAAACCTCATTGTGAAGTAACAAATATTGCCTATAACACTGAGGACAAAAATTCCGCATATCAAGGAAGTGAAGAAGGAAAGTTTTCATCATTGAATAAAAGGAAGTACAGAATGCTGGAAGGAGATTCTAGGTCGGACGC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057803981.1
MTDLLMYEFEDIGWDDLCQSDDHIVPRPLEDHSLLRDSCKKPHCEVTNIAYNTEDKNSAYQGSEEGKFSSLNKRKYRMLEGDSRSDAPSGVFSSSTDADSIKVASSLASEKTASSSHVHGNSNTDSHGNQFCGDGTVVGVGTTGFKNNSSTDPLGGITHAGNDLNFFENEEEKDSSDFLDFGWPEIENFEDVDRIFRSCDSTFGLGASREDEFRWFSSPDNIGGTGEFVNSDFKFQSPESNSAENLSSNHDFLKAHSSND...

XP_057803982.1
MTDLLMYEFEDIGWDDLCQSDDHIVPRPLEDHSLLRDSCKKPHCEVTNIAYNTEDKNSAYQGSEEGKFSSLNKRKYRMLEGDSRSDAPSGVFSSSTDADSIKVASSLASEKTASSSHVHGNSNTDSHGNQFCGDGTVVGVGTTGFKNNSSTDPLGGITHAGNDLNFFENEEEKDSSDFLDFGWPEIENFEDVDRIFRSCDSTFGLGASREDEFRWFSSPDNIGGTGEFVNSDFKFQSPESNSAENLSSNHDFLKAHSSND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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