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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001431`

染色体: Chr04 坐标: 23343883-23345025 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001431`
名称	SmilChr04G001431
描述	uncharacterized SmilChr04G001431
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	23343883 - 23345025 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023171`
GeneID	`131023171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023171`
原始查询	`SmilChr04G001431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=37.2; qcov=0.419; evalue=3.2e-19; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808699.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808699.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808699.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808699.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:23344075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:23344090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B8,B86,C25
`Chr4:23344189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A3,B140,B2,B71,B74,B86,B90,C69
`Chr4:23344204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B2,B71,B74
`Chr4:23344335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A1,A14,A3,B102,B109,B111,B123,B132,B137,B17,B26,B3,B59,B6,B69,B70,B86,C21,C37,C41,C45,C6,C65,C67,C77,C82,D7
`Chr4:23344402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:23344569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A14,A19,A6,B10,B136,B139,B140,B19,B37,B4,B45,B61,B7,B72,B73,B80,B83,B87,B97,C18,C20,C22,C28,C3,C38,C40,C44,C6,C78,C81,D9
`Chr4:23344596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C55,C6
`Chr4:23344605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B140,C55,C6
`Chr4:23344637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,C18,C22,C44
`Chr4:23344665`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A18,B11,B46,B69
`Chr4:23344665`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A18,B11,B46,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808699.1

346 aa

173

346

RVT_1

PF00078 RVT_1 238-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808699.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	238	328	1e-08	36.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952716.1
ATGGCCCTAAATGCTAGTCTGAAACTGTCGGACAGTCCATTGTATGGTTTTACCGGAAAATCCATTACGCCCTTGGGATCTCTAGAACTACCAATGATGTGGGAAAATGAGGAAGCTTCACGAACCAGGATTCTCAAGTTTTTGGTGGTGGATTCTCCCAAACCGAGTTACAACATCATTGTGGAAAGGCCAGCGATGAATGCTTTCCAAGCTATAATTTCTATGTATCATCTGAAAATGAAGTTCCCTTTAGAAGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023171
ATGGCCCTAAATGCTAGTCTGAAACTGTCGGACAGTCCATTGTATGGTTTTACCGGAAAATCCATTACGCCCTTGGGATCTCTAGAACTACCAATGATGTGGGAAAATGAGGAAGCTTCACGAACCAGGATTCTCAAGTTTTTGGTGGTGGATTCTCCCAAACCGAGTTACAACATCATTGTGGAAAGGCCAGCGATGAATGCTTTCCAAGCTATAATTTCTATGTATCATCTGAAAATGAAGTTCCCTTTAGAAGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808699.1
MALNASLKLSDSPLYGFTGKSITPLGSLELPMMWENEEASRTRILKFLVVDSPKPSYNIIVERPAMNAFQAIISMYHLKMKFPLEGGRMGKIVGNQITSKECFVRSLTSQAGSKRIQNGQGGSAEKIARAGGSSGNTAEMAEIEKIRRSSDKQPMISTDDRCMLVELFLGKTDLKGIDRTLAEHHLNVDPLRKLVIQKIRYFRPEKDTTIREQVKDLLQAGHIVEVQYLVWLSNEMTVEKKEKEWRICVDYRDLNVACPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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