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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001435`

染色体: Chr04 坐标: 23411064-23415327 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001435`
名称	SmilChr04G001435
描述	metacaspase-1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	23411064 - 23415327 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019471`
GeneID	`131019471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019471`
原始查询	`SmilChr04G001435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metacaspase-1-like
产物	metacaspase-1-like
Arabidopsis	`AT1G02170` (MC1) metacaspase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839561] identity=40.6; qcov=0.905; evalue=3.98e-79; confidence=medium
Rice	`Os10g0565100` - identity=44.6; qcov=0.841; evalue=2.77e-83; confidence=medium
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00656 (Peptidase_C14); PF31181 (Pept_C14_Metacaspase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804003.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804003.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057804003.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804003.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:23411225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:23411931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B67,C18,C22,C44
`Chr4:23411966`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr4:23411966`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr4:23412046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B65,B84
`Chr4:23412090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:23412123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,C22,C44
`Chr4:23413774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:23414387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B60,C35
`Chr4:23414389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B58,B66
`Chr4:23414622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:23414668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B41,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804003.1

378 aa

189

378

Pept_C14_Metacaspase

Peptidase_C14

PF31181 Pept_C14_Metacaspase 102-250 aa PF00656 Peptidase_C14 102-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804003.1`	Pfam	`PF31181`	Pept_C14_Metacaspase	Domain	102	250	1.4e-47	162.7	Metacaspase, peptidase C14 domain
`XP_057804003.1`	Pfam	`PF00656`	Peptidase_C14	Domain	102	338	2.9e-27	96.6	Caspase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100266.1
TGAACTTTTTAATGTCACATTCAAAATATATATAGAAAATATATAAGTTTTTTCTGCGTCTAGCCCCGCATATCATTCCTTATTCCTTCACATGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATACAAGTCAACAGAAGGTTCAGACAATTGATCATCACCATTAATTCAAAACACCTAGCTAATATTGTTGAAGATGGAAGCCCTGACATGCAAGAAATGCAGACGAACCTCGTCGCTGCCATCAAGTGCGCAG...

XM_057948020.1
TGAACTTTTTAATGTCACATTCAAAATATATATAGAAAATATATAAGTTTTTTCTGCGTCTAGCCCCGCATATCATTCCTTATTCCTTCACATGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATACAAGTCAACAGAAGGTTCAGACAATTGATCATCACCATTAATTCAAAACACCTAGCTAATATTGTTGAAGATGGAAGCCCTGACATGCAAGAAATGCAGACGAACCTCGTCGCTGCCATCAAGTGCGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019471
ATGGAAGCCCTGACATGCAAGAAATGCAGACGAACCTCGTCGCTGCCATCAAGTGCGCAGCGCATCCGCTGCTACGGATGCAAAACAGTCTACTCACTGAGCACCACCACCACCACCACTACCGACGCCGTACGCTACAAGGGCAGCACCACCGATGAACGGAGCCTCGACTTGTCCAAGAACAAGACCGAAGCGAAGCTCTGCCGCAGCTTGCGGAGAAAACTACCCTTCACCAACCCGGCGCCGCAGCAGAGCCCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804003.1
MEALTCKKCRRTSSLPSSAQRIRCYGCKTVYSLSTTTTTTTDAVRYKGSTTDERSLDLSKNKTEAKLCRSLRRKLPFTNPAPQQSPSLPGAISLDNEAHRGRRALICGVSYKNQKHELKGSAQDVKKMSSLLLDHYHFPAESVLILAEQEPYLPPTRRHIEAGFEWLMRGVQRGDSLVFYFSGHGKRQREVVRGDEIDGFDETICPVDFEENGMIVDNYINRAIVRPLVPGVTLHAIIDSCHSGTILDLPHVYDIKGKWE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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