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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001467`

染色体: Chr04 坐标: 24095505-24103830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001467`
名称	SmilChr04G001467
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24095505 - 24103830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023181`
GeneID	`131023181`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023181`
原始查询	`SmilChr04G001467`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33840` (AT4G33840) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829526] identity=44.2; qcov=0.799; evalue=5.31e-168; confidence=medium
Rice	`Os03g0201901` - identity=42.8; qcov=0.799; evalue=5.54e-166; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10); PF02018 (CBM_4_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023181

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057808710.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057808710.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808710.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808710.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808710.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24095506`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A16,B120,B44,B59,B84,C14,C2
`Chr4:24095649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C7,C72,D8
`Chr4:24095690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B114,C43,C53
`Chr4:24095697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:24095699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D8
`Chr4:24095702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C53
`Chr4:24095709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B81
`Chr4:24095723`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B23,D8
`Chr4:24095723`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B23,D8
`Chr4:24095741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:24095763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B90
`Chr4:24095774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A5,B109,B26,B41,B66,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808710.1

707 aa

354

707

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 163-280 aa PF00331 Glyco_hydro_10 346-602 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808710.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	163	280	6e-08	33.9	Carbohydrate binding domain
`XP_057808710.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	346	602	9.4e-31	107.9	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952727.1
ATGCAGTTCAGAGCAGAGCTCAGGATGCAGAGCAGAGCCGAGTTTCAGAGGCTGCACAGAGTGAAGATCCGGTACATGTGCGTGCTCGTTGGTCCGGTGAGGAGAGCTAGAGCTGATGCAGTTCAGAGCAGAGCTCAGGATGCAGAGCAGAGCCGAGTTTCAGAGGCTGCACAGAGTGAAGATCCGGTACATGTGCCCGTTGGTCCGGTGACGAGAGCTAGAGCCAAGACGTTCAAGGCTAATTTAATGACGTTGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023181
ATGCAGTTCAGAGCAGAGCTCAGGATGCAGAGCAGAGCCGAGTTTCAGAGGCTGCACAGAGTGAAGATCCGGTACATGTGCGTGCTCGTTGGTCCGGTGAGGAGAGCTAGAGCTGATGCAGTTCAGAGCAGAGCTCAGGATGCAGAGCAGAGCCGAGTTTCAGAGGCTGCACAGAGTGAAGATCCGGTACATGTGCCCGTTGGTCCGGTGACGAGAGCTAGAGCCAAGACGTTCAAGGCTAATTTAATGACGTTGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808710.1
MQFRAELRMQSRAEFQRLHRVKIRYMCVLVGPVRRARADAVQSRAQDAEQSRVSEAAQSEDPVHVPVGPVTRARAKTFKANLMTLVEEIWRQELKRPIGEGLTDQSSKVHRTMKYFQGATFVVLCALLISGCALAESDSSNYDYKANIRCMVEALDPQYEGGMVNDPTFSSDLDDWKVYGNANIEKRKSTKSDNYYLVAYNRSQPLDGFSQSFDLQKDLLYTFSAWLQVDQGEETILAYMVTPSGEHMAAGSVIAKSGCW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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