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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001469`

染色体: Chr04 坐标: 24121707-24130736 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001469`
名称	SmilChr04G001469
描述	uncharacterized SmilChr04G001469
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24121707 - 24130736 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019498`
GeneID	`131019498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019498`
原始查询	`SmilChr04G001469`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0758100; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0758100; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G65290` (AT5G65290) LMBR1-like membrane protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836654] identity=55.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0758100` - identity=70; qcov=0.741; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04791 (LMBR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057804023.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057804025.1`
3	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057804023.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804023.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804023.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24121754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C25,C52
`Chr4:24123526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:24123598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:24123640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,C85
`Chr4:24124458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C43
`Chr4:24124459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C43
`Chr4:24124514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B88,C27,C55
`Chr4:24124525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:24125264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:24125472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C52
`Chr4:24125487`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr4:24125487`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804023.1

712 aa

356

712

LMBR1

PF04791 LMBR1 4-496 aa

XP_057804024.1

683 aa

342

683

LMBR1

PF04791 LMBR1 4-467 aa

XP_057804025.1

580 aa

290

580

LMBR1

PF04791 LMBR1 4-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804023.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	4	496	3.4e-96	323.9	LMBR1-like membrane protein
`XP_057804024.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	4	467	5.4e-89	300.1	LMBR1-like membrane protein
`XP_057804025.1`	Pfam	`PF04791`	LMBR1	Family	4	364	9.5e-69	233.3	LMBR1-like membrane protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948041.1
ATCATAGTGGAGAATGTGGGTGTTGTATGTGTTATCTCTGCCGCTGACGGTGGGGATGGTGGGCTGGACCCTTTGGTACTTCGTCGGCCCCGATGTCCCCTTTTATGTCTGCGTCACCGTCGGCTACACCTGGTTCTGCTCCCTCTTTATGATCTTCCTTGTCCCCGCCGACATCTGGGCTACAATCAGCAACAAAGGAGGCATCTCCTTCTTGTGGAGCTGGTCATATTGGAGTTCATTTCTACTTACATGGGTTGTGG...

XM_057948040.1
ATCATAGTGGAGAATGTGGGTGTTGTATGTGTTATCTCTGCCGCTGACGGTGGGGATGGTGGGCTGGACCCTTTGGTACTTCGTCGGCCCCGATGTCCCCTTTTATGTCTGCGTCACCGTCGGCTACACCTGGTTCTGCTCCCTCTTTATGATCTTCCTTGTCCCCGCCGACATCTGGGCTACAATCAGCAACAAAGGAGGCATCTCCTTCTTGTGGAGCTGGTCATATTGGAGTTCATTTCTACTTACATGGGTTGTGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019498
ATGTGGGTGTTGTATGTGTTATCTCTGCCGCTGACGGTGGGGATGGTGGGCTGGACCCTTTGGTACTTCGTCGGCCCCGATGTCCCCTTTTATGTCTGCGTCACCGTCGGCTACACCTGGTTCTGCTCCCTCTTTATGATCTTCCTTGTCCCCGCCGACATCTGGGCTACAATCAGCAACAAAGGAGGCATCTCCTTCTTGTGGAGCTGGTCATATTGGAGTTCATTTCTACTTACATGGGTTGTGGCACCTGTAATTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804023.1
MWVLYVLSLPLTVGMVGWTLWYFVGPDVPFYVCVTVGYTWFCSLFMIFLVPADIWATISNKGGISFLWSWSYWSSFLLTWVVAPVIQGYEDAGDFTLRDRLKTSVHVNLIYYLCVGSIALFGLVLLIIMHKDWGGNILGLAMACANTFGLVTGAFLLGYGLSEIPKGVWRNANWTNRHKILSHNVYRMAVKLDDAHQEFSNAIVVAQATSKQMSKHDPLKPYMNKIDKMLVKMLNEDPTFKPQGGKLGEDDMDYDTDKKS...

XP_057804024.1
MWVLYVLSLPLTVGMVGWTLWYFVGPDVPFYVCVTVGYTWFCSLFMIFLVPADIWATISNKGGISFLWSWSYWSSFLLTWVVAPVIQGYEDAGDFTLRDRLKTSVHVNLIYYLCVGSIALFGLVLLIIMHKDWGGNILGLAMACANTFGLVTGAFLLGYGLSEIPKGVWRNANWTNRHKILSHNVYRMAVKLDDAHQEFSNAIVLNEDPTFKPQGGKLGEDDMDYDTDKKSMASLRRHLRRARERYYRYKSEYTNFVREA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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