当前解析结果
SmilChr04G001473| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001473 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001473 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001473 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 24171499 - 24179498 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023182 |
|---|---|
| GeneID | 131023182 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023182 |
| 原始查询 | SmilChr04G001473 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023182 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057808711.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057808711.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057808711.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808711.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808711.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:24172377 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr4:24172383 |
A |
AAT |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 15 | A6,B100,B103,B126,B16,B18,B32,B95,C22,C28,C35,C38,C40,C59,C85 |
Chr4:24172418 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 11 | A21,A24,B1,B2,B35,B49,B68,B90,B92,C21,C73 |
Chr4:24174205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,B2 |
Chr4:24174211 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr4:24174236 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B51,B80 |
Chr4:24174343 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 30 | A9,B121,B129,B17,B47,B51,B53,B61,B63,B66,B67,B69,B71,B72,B78,B88,B93,C22,C24,C29,C35,C41,C44,C5,C52,C8,C87,D1,D4,D9 |
Chr4:24174360 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A2,B30,B82,B98,C24 |
Chr4:24174360 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A2,B30,B82,B98,C24 |
Chr4:24174370 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C46 |
Chr4:24174391 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 128 | A1,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A23,A25,A3,A7,A9,B101,B102,B103,B108,B109,B11,B113,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B124,B127,B128,B130,B131,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B21,B29,B3,B31,B32,B34,B4,B46,B47,B49,B5,B53,B58,B59,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B86,B89,B90,B92,B93,B94,B95,C10,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C28,C33,C34,C35,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C46,C48,C5,C51,C52,C53,C54,C57,C59,C61,C67,C68,C7,C72,C73,C74,C75,C78,C83,C86,C87,C9,D11,D5,D6,D9 |
Chr4:24179457 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B77,C38 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。