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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001496`

染色体: Chr04 坐标: 24511870-24517225 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001496`
名称	SmilChr04G001496
描述	uncharacterized SmilChr04G001496
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24511870 - 24517225 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019520`
GeneID	`131019520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019520`
原始查询	`SmilChr04G001496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159]; symbol=AT2G06040; hit=AT2G06040; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159]; symbol=AT2G06040; hit=AT2G06040; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G06040` (AT2G06040) F-box/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815159] identity=40.1; qcov=0.833; evalue=1.8e-152; confidence=medium
Rice	`Os08g0459100` - identity=47.8; qcov=0.506; evalue=2.27e-130; confidence=medium
GO	GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804049.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804049.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804049.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804049.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804049.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24513701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C45
`Chr4:24513721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B46,B73,B91,C2
`Chr4:24514038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:24514303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B63,C53,C85
`Chr4:24514312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:24514327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	91	A1,A11,A14,A15,A19,A2,A20,A22,A24,A4,A6,A8,A9,B1,B10,B106,B108,B110,B118,B120,B126,B129,B130,B132,B133,B135,B136,B138,B19,B35,B36,B37,B45,B49,B5,B53,B54,B58,B61,B63,B7,B72,B73,B74,B75,B78,B8,B80,B82,B83,B87,B88,B89,B9,B95,B97,C1,C17,C19,C20,C26,C28,C3,C30,C31,C33,C35,C36,C38,C4,C40,C42,C45,C46,C50,C53,C58,C59,C70,C71,C72,C74,C78,C8,C80,C81,C83,C84,C86,D5,D9
`Chr4:24514492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,D10
`Chr4:24515253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:24515257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B91,C38
`Chr4:24515430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B46,B91,C2,C38
`Chr4:24515438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B4,B85,C75
`Chr4:24515622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948066.1
GGAGAGTACTATACAACCGCCAATTCTCCTTTAGGGTTAACTCTACTTTTGGCGGGAAATACGAAGCGGCTCAAGAGTCAAAAATCAACTGATGCGTGTCCTGCAAAATCGAGAGTTGATCTCAAATCCAACGCTGTGCGCCGCCCTCTGCCACTTCCACCCACCCTCCTTCATTGCTCGGTTGCGTCGAAATGACGGTGTTGAGATCTAGGGAGATTTTGTCTACTCCCAAACGGAAGCCGTCGCAGGCATCGGCTCCG...

XM_057948067.1
TATACAACCGCCAATTCTCCTTTAGGGTTAACTCTACTTTTGGCGGGAAATACGAAGCGGCTCAAGAGTCAAAAATCAACTGATGCGTGTCCTGCAAAATCGAGAGTTGATCTCAAATCCAACGCTGTGCGCCGCCCTCTGCCACTTCCACCCACCCTCCTTCATTGCTCGGTTGCGTCGAAATGACGGTGTTGAGATCTAGGGAGATTTTGTCTACTCCCAAACGGAAGCCGTCGCAGGCATCGGCTCCGAGAAATGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131019520
ATGACGGTGTTGAGATCTAGGGAGATTTTGTCTACTCCCAAACGGAAGCCGTCGCAGGCATCGGCTCCGAGAAATGTTGTTGGTGAACCGGTGACGCCGCCGAAAACCTCTGAATTCCTGAATCCATCACCGAAGTGTGTGTGTACCCCGAAGCGAGATATTCTCGATTCCGAAATAGGGTTTGTTGTTGGGGCCGGCTCATTTGTGGTTTCTGAAAGTGTAAGTGTGCGAAGACACAGTTCTCGGTTGGCGAAAAAGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804049.1
MTVLRSREILSTPKRKPSQASAPRNVVGEPVTPPKTSEFLNPSPKCVCTPKRDILDSEIGFVVGAGSFVVSESVSVRRHSSRLAKKAGENVEVGSGKRKKVEGTSLPCVNTRNRKRHGSDMKLGVESSDGNPDANIVLEVKQDSDDGQDSDDGGFVELLKDSEKIEDSVSAARLGFGYDMIHSVRETRDNGKCKRQLSMDMNALGPESSEKDKLEKGFLSLRSGKRVPQREINNIHTTGDLFQGIQHSKEVGAVCSDDVP...

XP_057804050.1
MTVLRSREILSTPKRKPSQASAPRNVVGEPVTPPKTSEFLNPSPKCVCTPKRDILDSEIGFVVGAGSFVVSESVSVRRHSSRLAKKAGENVEVGSGKRKKVEGTSLPCVNTRNRKRHGSDMKLGVESSDGNPDANIVLEVKQDSDDGQDSDDGGFVELLKDSEKIEDSVSAARLGFGYDMIHSVRETRDNGKCKRQLSMDMNALGPESSEKDKLEKGFLSLRSGKRVPQREINNIHTTGDLFQGIQHSKEVGAVCSDDVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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