当前解析结果
SmilChr04G001502| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001502 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001502 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001502 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 24627265 - 24628260 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023193 |
|---|---|
| GeneID | 131023193 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023193 |
| 原始查询 | SmilChr04G001502 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023193 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808721.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057808721.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057808721.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.20000 | XP_057808721.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057808721.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:24627274 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 82 | A11,A13,A15,A16,A20,A21,A23,A25,A4,A8,B1,B10,B105,B110,B113,B120,B122,B126,B130,B131,B138,B2,B20,B22,B25,B28,B30,B31,B34,B37,B44,B49,B5,B51,B53,B54,B63,B65,B66,B71,B74,B79,B8,B80,B83,B84,B89,B9,B91,B93,B95,B99,C10,C13,C14,C18,C19,C2,C3,C32,C35,C46,C52,C54,C57,C58,C59,C67,C7,C70,C76,C79,C81,C82,C83,C9,D10,D11,D2,D5,D8,D9 |
Chr4:24627279 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B50 |
Chr4:24627279 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr4:24627293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,C52 |
Chr4:24627296 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B21,C27 |
Chr4:24627299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,B21,C27 |
Chr4:24627303 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B131,B62,B89,C75,D10 |
Chr4:24627310 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,B21 |
Chr4:24627318 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,C51 |
Chr4:24627324 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B62,D10 |
Chr4:24627326 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:24627330 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 118 | A11,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A4,A6,A8,B1,B10,B104,B105,B110,B113,B117,B120,B122,B126,B128,B130,B131,B136,B138,B19,B2,B20,B25,B26,B27,B28,B30,B31,B34,B35,B36,B37,B41,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B58,B61,B63,B65,B66,B7,B71,B73,B74,B79,B8,B80,B82,B83,B84,B87,B88,B89,B9,B91,B93,B95,B97,B99,C10,C13,C14,C18,C19,C2,C20,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C38,C42,C44,C46,C48,C50,C52,C54,C57,C58,C59,C62,C67,C68,C7,C70,C76,C78,C79,C81,C82,C83,C84,C9,D11,D2,D5,D7,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。