当前解析结果
SmilChr04G001507| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001507 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001507 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001507 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 24834563 - 24837292 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131019530 |
|---|---|
| GeneID | 131019530 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131019530 |
| 原始查询 | SmilChr04G001507 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131019530 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057804059.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057804059.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057804059.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057804059.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057804059.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:24834850 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B47,C53 |
Chr4:24834851 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A2,A8 |
Chr4:24834870 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,C52 |
Chr4:24834890 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B114,B48,B60,C35 |
Chr4:24834944 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A8 |
Chr4:24834947 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B22 |
Chr4:24834957 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:24834962 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr4:24835058 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B50,B85,C75 |
Chr4:24835082 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B59 |
Chr4:24835092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B90,C87 |
Chr4:24835093 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B17,C45,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。