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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001508`

染色体: Chr04 坐标: 24840439-24845914 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001508`
名称	SmilChr04G001508
描述	protein HESO1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	24840439 - 24845914 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019531`
GeneID	`131019531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019531`
原始查询	`SmilChr04G001508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HESO1
产物	protein HESO1
Arabidopsis	`AT2G39740` (HESO1) Nucleotidyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818559] identity=56.4; qcov=0.778; evalue=1.09e-134; confidence=high
Rice	`Os01g0846500` (OsNTP3) - identity=46.3; qcov=0.826; evalue=4.97e-103; confidence=high
GO	GO:0050265 (RNA uridylyltransferase activity); GO:0071076 (GO:0071076)
KEGG	-
Pfam	PF22600 (MTPAP-like_central)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804061.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057804061.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057804061.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057804061.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:24843796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B48,B60,C35
`Chr4:24844247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:24845440`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B17,C45
`Chr4:24845440`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B17,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804061.1

442 aa

221

442

MTPAP-like_central

PF22600 MTPAP-like_central 8-144 aa

XP_057804063.1

442 aa

221

442

MTPAP-like_central

PF22600 MTPAP-like_central 8-144 aa

XP_057804064.1

442 aa

221

442

MTPAP-like_central

PF22600 MTPAP-like_central 8-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804061.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	8	144	5.3e-24	85.6	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain
`XP_057804063.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	8	144	5.3e-24	85.6	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain
`XP_057804064.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	8	144	5.3e-24	85.6	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948081.1
GTACTAAAGTAAAAATATCAAATTTATTATAAATAAATACAAATAGAAAATAATTGAGAATACACTCCCCCGGCCCGGCGGCGTCTTGTCTTTCCACACAGAAAACAAACCCTTGCCCTTAAGCAAACCCCAGTTGCTGCCTACCAGTCCCATGGATTCCGTTCATTCCAATCAAATGCTAATTCAGCCCTAATTTTAAAGGGGATGTCAGCTTACAGCCACAATCAAAATGAATGGGTATAATCAGGTAGAGCAAACTC...

XM_057948080.1
TACACTCCCCCGGCCCGGCGGCGTCTTGTCTTTCCACACAGAAAACAAACCCTTGCCCTTAAGCAAACCCCAGTTGCTGCCTACCAGTCCCATGGATTCCGTTCATTCCAATCAAATGCTAATTCAGCCCTAATTTTAAAGGTCCATATTTCCTGGCCCGTCAAACAAGTTTCCTTGCTTTAGAAGCTTCTTGCGAACATTTGGAGTTTTATCCTTTCCCTTTTTTTTTTTCTCCATATTTTAGGGTCAAGTGCCCGGTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019531
ATGAATGGGTATAATCAGGTAGAGCAAACTCTGAATGATATTCTTCGTGCAATTAATCCCTCAAAAGAAGATTGGACAATCAGATTTCATATTATAAATGAGGTCCGGGATGTTATTCGATCCATAGAAAGTTTGAGAGGTGGAACTGTAGAACCATATGGATCTTTTGTGTCCAACCTCTTTACAAAATGGGGAGATTTAGATATATCCATTGAGTTACCAAATGGTTCATATATTTCTTCTCCTGGAAAGAAGCACAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804061.1
MNGYNQVEQTLNDILRAINPSKEDWTIRFHIINEVRDVIRSIESLRGGTVEPYGSFVSNLFTKWGDLDISIELPNGSYISSPGKKHKQTLLADVIKALRKKGGFRRLQFISNARVPIVKFEGNFNISCDLSVNNLSGQMKSKILFWISGIDNRFRDLVLLVKEWAKTHHINDSKSGTLNSYCLSLLVLFHFQTLEPAILPPLIEIYPGNMTDDLTGVRAVAEKNIEDTCAVNIKKIRSDRSRSINWSSLSELFLSFLAKF...

XP_057804063.1
MNGYNQVEQTLNDILRAINPSKEDWTIRFHIINEVRDVIRSIESLRGGTVEPYGSFVSNLFTKWGDLDISIELPNGSYISSPGKKHKQTLLADVIKALRKKGGFRRLQFISNARVPIVKFEGNFNISCDLSVNNLSGQMKSKILFWISGIDNRFRDLVLLVKEWAKTHHINDSKSGTLNSYCLSLLVLFHFQTLEPAILPPLIEIYPGNMTDDLTGVRAVAEKNIEDTCAVNIKKIRSDRSRSINWSSLSELFLSFLAKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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