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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001516`

染色体: Chr04 坐标: 25020242-25025321 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001516`
名称	SmilChr04G001516
描述	CASP-like protein 5B1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25020242 - 25025321 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019538`
GeneID	`131019538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019538`
原始查询	`SmilChr04G001516`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 5B1
产物	CASP-like protein 5B1
Arabidopsis	`AT3G53850` (AT3G53850) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824552] identity=62.3; qcov=1; evalue=9.05e-68; confidence=high
Rice	`Os01g0847300` - identity=61.7; qcov=1; evalue=6.91e-60; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804085.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804085.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804085.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804085.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804085.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25024901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804085.1

154 aa

154

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 7-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804085.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	7	139	3e-27	96.0	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948102.1
GTGACAAACACATTTCAAACGAAGGTGTCCAAATTTCTGTGGCTAACTAAAATAAATGAATAATTTGGCAAATCTATTTGTCTACTCCTTGAATAAAAAGCATAATAAACAGCCACAATTATACCTTTTGTGTCCATATTTTTAAAACATTTTTCAGCTTTCTTTTTCTTTTCAGTTGGTGAGGTTGGTAAAGGATCACAGCAGATGATTCGGGCAACGAGATTCAGATCAAAAATCAGCCCTTCTTCTTCGGTGATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019538
ATGAAGGAGCTGTTCGGGAGCCCAGGGAGAAAAAGTGGGCTGATATTGAGGATTGGGCAGTGTGTGTCTGCAGCTGCTTCAATTGGGGTCATGGCCTCTGCTTCTGGCTTCTCAACTACTACTGCCTTTTGCTACTTAATTGCATCAATGGGGCTTCAGGTTTTGTGGAGCTTTGGACTCATGTGCCTAGACATACATGCTTTGAGGTTCAACAAGGACCTCCATACCAACATTATTGTGAGCCTGTTTGTCGTCGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804085.1
MKELFGSPGRKSGLILRIGQCVSAAASIGVMASASGFSTTTAFCYLIASMGLQVLWSFGLMCLDIHALRFNKDLHTNIIVSLFVVGDWVTATLSLAAACSSAGVMVLFTRDTDICNIDLNLSCDMFQISIAFAFASWFLLAISSYIMFWLVASI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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