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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001522`

染色体: Chr04 坐标: 25133386-25134637 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001522`
名称	SmilChr04G001522
描述	ras-related protein Rab2BV-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25133386 - 25134637 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019545`
GeneID	`131019545`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019545`
原始查询	`SmilChr04G001522`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein Rab2BV-like
产物	ras-related protein Rab2BV-like
Arabidopsis	`AT1G07410` (RABA2b) RAB GTPase homolog A2B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837253] identity=82.9; qcov=1; evalue=1.65e-132; confidence=high
Rice	`Os03g0823700` (OsRab11B2) - identity=81.6; qcov=1; evalue=1.22e-128; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005768 (endosome)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019545

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057804095.1`
2	Phagosome	Phagosome	1.00000	`XP_057804095.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057804095.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057804095.1`
5	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057804095.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25133583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,C38,C57
`Chr4:25133763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr4:25133784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr4:25133891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:25133916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:25133940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:25134255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,C38,C57,D10,D11
`Chr4:25134264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804095.1

216 aa

108

216

Arf

MMR_HSR1

Roc

Ras

PF00025 Arf 13-164 aa PF01926 MMR_HSR1 14-121 aa PF08477 Roc 14-128 aa PF00071 Ras 14-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804095.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	13	164	7.3e-14	52.3	ADP-ribosylation factor family
`XP_057804095.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	14	121	3.8e-06	27.7	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057804095.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	14	128	2.9e-35	121.8	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057804095.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	14	174	8.7e-62	208.2	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948112.1
GACCGTTTAAATTCCTGTTATATCGCTTATTCTGTTTATCTCAACAGCAACACAAAACACCTTTTTCTTTTTCACTAAGCACCCCACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTGACAAATCAAGAATAATTTTTGTAAATTGGCAATGGTGTACTGTACAAAATCGGTTGATTAGTGGGGACGAAGAAATCAATGGCGTATAAGGTAGATCACGAGTATGATTACTTGTTCAAGATCGTGTTGATTGGAGATTCAGGTGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019545
ATGGCGTATAAGGTAGATCACGAGTATGATTACTTGTTCAAGATCGTGTTGATTGGAGATTCAGGTGTTGGAAAATCCAACATTTTGTCAAGATTTACAAGGAATGAATTCTGTTTAGAGTCCAAATCCACAATCGGCGTTGAATTCGCGACGAGGACTCTCCAGGTGGAGGGGAAGACGGTGAAGGCGCAGATATGGGACACGGCGGGGCAGGAGCGGTACCGCGCGATCACGAGCGCGTACTACCGCGGCGCGGTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804095.1
MAYKVDHEYDYLFKIVLIGDSGVGKSNILSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGKTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALVVYDLTKRQTFENVQRWLRELRDHADSNIVIMLAGNKSDLNHLRVVAEHDAQLFAEKEGLSFLETSALEAHNVEKAFQTILLDIYQIISRKALAAQEAAAPLPGQGTTIKVGEPNNFQQPKASCCST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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