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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001524`

染色体: Chr04 坐标: 25158505-25162846 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001524`
名称	SmilChr04G001524
描述	cucumisin-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25158505 - 25162846 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019547`
GeneID	`131019547`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019547`
原始查询	`SmilChr04G001524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cucumisin-like
产物	cucumisin-like
Arabidopsis	`AT5G59190` (AT5G59190) subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836037] identity=49.6; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0605300` (OsSub30) - identity=42.3; qcov=1.03; evalue=2.38e-174; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019547

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057804097.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057804097.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804097.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804097.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804097.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25158580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:25158600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr4:25160057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B128,C16,C62,D3
`Chr4:25160097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr4:25160664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C80,C86
`Chr4:25161118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:25161145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C87,D6
`Chr4:25161173`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr4:25161173`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr4:25161403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B71,B92,C36
`Chr4:25161566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C23,C85
`Chr4:25161593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804097.1

734 aa

367

734

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 32-106 aa PF00082 Peptidase_S8 127-568 aa PF17766 fn3_6 632-729 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804097.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	32	106	4.3e-13	50.5	Peptidase inhibitor I9
`XP_057804097.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	127	568	3.6e-42	145.3	Subtilase family
`XP_057804097.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	632	729	1.2e-27	96.6	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948114.1
TCCAACTCCGAAGCCGAAGCCCTCTTCTGTTCCATGGCGACTTCAGCTTTGTGCAAGGCCGTTTTAGCGGTTGCTCTCTTCTCACTGGTTATGAGCTGCAGCGCCGGAATTTCTCAACATCAAAAGGTGTACATAGTTTATATGGGCGATCGTCCAAAAGGAGACTTCTCTGCTACAATGCAGCACATGACCTTGCTACACGCAACTTTGGGAAGCACGGAGTCGTGGCTCTATAGCTACAAGAGAAGCTTCAATGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019547
ATGGCGACTTCAGCTTTGTGCAAGGCCGTTTTAGCGGTTGCTCTCTTCTCACTGGTTATGAGCTGCAGCGCCGGAATTTCTCAACATCAAAAGGTGTACATAGTTTATATGGGCGATCGTCCAAAAGGAGACTTCTCTGCTACAATGCAGCACATGACCTTGCTACACGCAACTTTGGGAAGCACGGAGTCGTGGCTCTATAGCTACAAGAGAAGCTTCAATGGCTTCGTCGCCAAGCTCACCGAGGAAGACAAAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804097.1
MATSALCKAVLAVALFSLVMSCSAGISQHQKVYIVYMGDRPKGDFSATMQHMTLLHATLGSTESWLYSYKRSFNGFVAKLTEEDKNKIASLEGVVSVFPSMKKQLHTTRSWDFMGFPLNVQRAQTESDVIVGMLDSGIWPESQSFDDVGFGPPPTKWKGSCQSSSNFTCNNKVIGAKYYDSEGAMNPPNSPSPRDYGGHGTHTASIAAGAWVSGASLYGLASGTARGGVPSARIAVYKICWRGSCSDADILAAFDDAIAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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