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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001525`

染色体: Chr04 坐标: 25171119-25172302 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001525`
名称	SmilChr04G001525
描述	uncharacterized SmilChr04G001525
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25171119 - 25172302 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023200`
GeneID	`131023200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023200`
原始查询	`SmilChr04G001525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=27.4; qcov=0.771; evalue=1.88e-26; confidence=low
Rice	`Os06g0658400` - identity=52.3; qcov=0.897; evalue=1.66e-95; confidence=high
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808725.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808725.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808725.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808725.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25171157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:25171182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:25171194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C11,C69
`Chr4:25171397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C11,C69
`Chr4:25171424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B101,B108,B23,B37,C16,C18,C27,C81
`Chr4:25171476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,C18,C22,C44
`Chr4:25171583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:25171728`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	33	A1,A14,A19,A3,B102,B103,B104,B109,B111,B112,B131,B137,B140,B17,B22,B26,B42,B43,B58,B59,B6,B65,B70,B80,C21,C23,C45,C50,C6,C67,C77,C82,C85
`Chr4:25171787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:25171798`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	56	A1,A11,A14,A22,A23,A3,A5,B102,B104,B107,B109,B111,B112,B119,B121,B124,B137,B22,B26,B28,B29,B31,B42,B43,B50,B53,B6,B63,B69,B70,B79,B80,B81,B82,B91,B93,C11,C21,C25,C29,C33,C42,C52,C53,C6,C60,C62,C65,C67,C69,C71,C77,C82,C84,C87,D11
`Chr4:25171965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:25172063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808725.1

341 aa

170

341

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 175-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808725.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	175	254	1.9e-10	41.1	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952742.1
ATGGTGATAAGTGAACAATGGTCTATGTATCATGAGGATAACATTGAAAAAGATAGAATTGTGAAAGAAAAATTGTTAGATGATGGCTGGTGGGATTCAGTAGATTATATTCTTCGTTTTACTGAGCCGATTTATTCGATGTTGAGAATTTGTGATACGGATAAACCTTGTCTGCACTTGGTTTATGGGATGTGGGATACCATGATAGTTAAAGTGAAACAAGTTATCTTTGAGCATGAGATGAAGAGTGACTTAGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023200
ATGGTGATAAGTGAACAATGGTCTATGTATCATGAGGATAACATTGAAAAAGATAGAATTGTGAAAGAAAAATTGTTAGATGATGGCTGGTGGGATTCAGTAGATTATATTCTTCGTTTTACTGAGCCGATTTATTCGATGTTGAGAATTTGTGATACGGATAAACCTTGTCTGCACTTGGTTTATGGGATGTGGGATACCATGATAGTTAAAGTGAAACAAGTTATCTTTGAGCATGAGATGAAGAGTGACTTAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808725.1
MVISEQWSMYHEDNIEKDRIVKEKLLDDGWWDSVDYILRFTEPIYSMLRICDTDKPCLHLVYGMWDTMIVKVKQVIFEHEMKSDLEESSFWNVVCNMLEDMWSKSNTQLHCLAHSLNPRCITEDWIKEHLYLQAPNHDADIVKMIKNCIKCLFPDAETRTTVTLEFANFFGCFEEFGDEDSIRDRLKLDPLKWWVAYGIGAPHLRSLAVRLLGQVSSSSCCERNWSTYLFIHSTKRNQITVERAEDLVYVHSNLRLLSRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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