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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001529`

染色体: Chr04 坐标: 25198009-25201041 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001529`
名称	SmilChr04G001529
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25198009 - 25201041 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021093`
GeneID	`131021093`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021093`
原始查询	`SmilChr04G001529`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 5-like
产物	rop guanine nucleotide exchange factor 5-like
Arabidopsis	`AT5G05940` (ROPGEF5) ROP guanine nucleotide exchange factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830479] identity=65; qcov=0.888; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0849100` (OsRacGEF1) - identity=65; qcov=0.852; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021093

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806166.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806166.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806166.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806166.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25198169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:25198212`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B108,B128,C16,C62,D3
`Chr4:25198212`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B108,B128,C16,C62,D3
`Chr4:25198240`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr4:25198240`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr4:25198262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D7
`Chr4:25198272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:25198376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B44
`Chr4:25198382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:25198559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B128,C16,C62,D3
`Chr4:25198571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:25198595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806166.1

580 aa

290

580

PRONE

PF03759 PRONE 81-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806166.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	81	450	9.1e-179	594.6	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950183.1
TCTTGTGACTTGGCAGTTACCTTCAAACTTTGAAAATCAAATCTCCACCCAAAACACACACTCAAAACACACAGTGAAATGATAAACCACTCTCCACTGTTAGATAAATGTAATAAAATCCAGTGTTCCACTGTACCCACAGAGACAATTCATGTCTAACCGTTTAAAGCTCAACTTTTTCCCCTCTTTATTTTTTTCGAAATCTTCCACCTTTTGTCCCTTGTCAAGATTGAATCTTTATGGCCGTCTTTGAAGCAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021093
ATGGCTTGTGCAGCTGGGAAGAGCGAAAAGAAAGAGGGGTCCGAGTTGGCGAGTGATGACTCGGTGAGTGGCAGCAGCACTAGTTGCGAGACCAGATCGACTTCCGCCAATTCTTGCTCAGCTCAATTGGGTTGGCCGATCAAGAAAGCCTCGAATCATGAAGGAAAGCGAAACCCTCGATTGAAAGCTGAGTGTGGTGATAGTGAGCCCATGTTCAAGAAGCAGGATTCTTCAAACTTTTCAGAAATGGAGATGATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806166.1
MACAAGKSEKKEGSELASDDSVSGSSTSCETRSTSANSCSAQLGWPIKKASNHEGKRNPRLKAECGDSEPMFKKQDSSNFSEMEMMKERFGKLLLGEDMSGGGKGVCPALAISNAITNLCATVFGQLWRLEPLQLEKKAMWRREMEWLLCVSDYIVELKPSWQTFPDGSRLEVMTSRPRLDLVINLPALQKLDNMLLEILEGFMETEFWYVDQGVVAPESDGSASFREAIQRQEDKWWLPVPRVPPGGLPEASKKQLINK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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