当前解析结果
SmilChr04G001530| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001530 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001530 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001530 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 25223137 - 25225362 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131022794 |
|---|---|
| GeneID | 131022794 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131022794 |
| 原始查询 | SmilChr04G001530 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131022794 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808302.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057808302.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808302.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808302.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808302.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:25223407 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C30 |
Chr4:25223541 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 142 | A10,A11,A15,A18,A2,A20,A21,A24,A25,A4,A6,A8,B10,B105,B11,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B122,B123,B125,B127,B129,B13,B132,B135,B136,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B27,B28,B31,B33,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B49,B52,B53,B56,B57,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B7,B71,B72,B75,B76,B79,B8,B80,B83,B85,B87,B89,B9,B90,B92,B95,B96,C1,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C29,C3,C30,C31,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C52,C53,C54,C58,C60,C61,C62,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C81,C87,C9,D2,D3,D5,D6,D9 |
Chr4:25223548 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B52 |
Chr4:25223548 |
T |
TTC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B52 |
Chr4:25223552 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,B82,C36,C48 |
Chr4:25223612 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr4:25223629 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr4:25223893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C57 |
Chr4:25223963 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C61 |
Chr4:25224678 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr4:25224929 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B49,C71 |
Chr4:25224955 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B52 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。