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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001531`

染色体: Chr04 坐标: 25235718-25237673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001531`
名称	SmilChr04G001531
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25235718 - 25237673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019971`
GeneID	`131019971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019971`
原始查询	`SmilChr04G001531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	molybdenum cofactor sulfurase-like
产物	molybdenum cofactor sulfurase-like
Arabidopsis	`AT1G16540` (ABA3) molybdenum cofactor sulfurase (LOS5) (ABA3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838224] identity=70.7; qcov=0.892; evalue=5.57e-72; confidence=high
Rice	`Os06g0670000` (MCSU3) - identity=63.9; qcov=0.898; evalue=4.33e-65; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804593.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804593.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057804593.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804593.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25236233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:25236445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B2,C83
`Chr4:25236794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,C18,C33
`Chr4:25236822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B26,B66,C43,C5
`Chr4:25236823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr4:25236835`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A14,B111,B118,B27,B5,B55,B82,B94,B98,C3,C40,C41,C5,C58,C6,C78,D2,D3
`Chr4:25236862`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr4:25236862`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr4:25237083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B14,B33
`Chr4:25237086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,C41
`Chr4:25237086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C41
`Chr4:25237317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B24,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804593.1

176 aa

176

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 52-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804593.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	52	165	9e-14	51.9	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948610.1
TGGAATTGAAATAATTGGGAAATATTTAAGCTTAAATAGAGAGGGTGTATTTGCTTTGATTAATTGAATCACATGGTTCACTCTCAGCTGCTGCGGACTAGGGTTTTTGCTTCTACCGAGAATGCTTTTTTGAAGCAGCCTAAGGTGTTTCTTTGGTGCCTGTTTGTTTAATACCCATGCTGTCGGAGTGCGTCGACCTGCCCCATGATCTTGCTCTACAGATATGGTGAGACGTACAATTTATTTGCATTTCCATCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019971
ATGATCTTGCTCTACAGATATGGTGAGACGTACAATTTATTTGCATTTCCATCGGAGTGTAACTTCTCAGGTCTTAGATTCAACCTTGACCTGGTTAATCCCATAAAGGAAGGTTCTTATCAAATGCCCGGAACTTCTCCAACTCAGAGTGGTCACTGGATGGTCCTGATTGATGCAGCAAAAGGAAGTTCAACATGCCCCCCTGATTTGTCAAAATACAAGGCAGACTTTGTTGTGGTCTCATTTTATAAGCTATTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804593.1
MILLYRYGETYNLFAFPSECNFSGLRFNLDLVNPIKEGSYQMPGTSPTQSGHWMVLIDAAKGSSTCPPDLSKYKADFVVVSFYKLFGYPTGIGALIARNESMKLLKKTYFSGGTVAASVADIDFYQRRDGVEEYFEDGTVSFLSIASLHHGFKVLNTLTIPAISRCHGPSSYHQHQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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