当前解析结果
SmilChr04G001532| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001532 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001532 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001532 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 25238617 - 25239166 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023201 |
|---|---|
| GeneID | 131023201 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023201 |
| 原始查询 | SmilChr04G001532 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023201 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057808726.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057808726.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057808726.1 |
| 4 | Mitochondrion intermembrane space | Mitochondrion intermembrane space | 0.20000 | XP_057808726.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057808726.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:25238662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr4:25238853 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B137,C3,C48 |
Chr4:25238858 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 38 | A1,A19,B115,B12,B121,B122,B123,B126,B21,B30,B31,B34,B45,B46,B5,B58,B59,B69,B82,B86,B87,B88,B9,B93,B97,C10,C15,C19,C23,C25,C26,C3,C34,C42,C47,C48,C50,C84 |
Chr4:25238883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B38,B82 |
Chr4:25238927 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,B129,B80,C70 |
Chr4:25238930 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C56,C61 |
Chr4:25238952 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B72,C33,C41 |
Chr4:25238952 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B72,C33,C41 |
Chr4:25239026 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr4:25239033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,C68 |
Chr4:25239041 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C36 |
Chr4:25239065 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B40,C44,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。