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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001543`

染色体: Chr04 坐标: 25524323-25527975 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001543`
名称	SmilChr04G001543
描述	uncharacterized SmilChr04G001543
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25524323 - 25527975 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019982`
GeneID	`131019982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019982`
原始查询	`SmilChr04G001543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468]; symbol=AT5G05830; hit=AT5G05830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05830` (AT5G05830) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830468] identity=56.5; qcov=1.03; evalue=2.91e-70; confidence=high
Rice	`Os01g0850200` (OsRFPV-3) - identity=62.4; qcov=0.751; evalue=1.03e-64; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF12906 (RINGv)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057804602.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804602.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804602.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804602.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25524589`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B58,B66
`Chr4:25524589`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B58,B66
`Chr4:25524659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B42,B43,B7,C41
`Chr4:25524689`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	45	A15,A6,A7,B112,B113,B12,B124,B125,B131,B133,B134,B137,B14,B15,B16,B24,B28,B32,B33,B38,B39,B42,B43,B47,B50,B6,B62,B65,B7,B77,B86,C22,C25,C34,C41,C55,C57,C63,C64,C66,C70,C73,D10,D11,D4
`Chr4:25527142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:25527169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804602.1

209 aa

104

209

RINGv

PF12906 RINGv 87-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804602.1`	Pfam	`PF12906`	RINGv	Domain	87	138	3.8e-11	43.7	RING-variant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948619.1
AAGTAATCATATTTTCATATTTCATAGTTTTACAAATACTCTTCTAAAAATCAATCAACTGCAGCCATTTTATTTTTACACGATGAGATCCTTGATCTACTAAACATAATAGTAATTATTTTATTAAAACTTGTAGAGAATCAAACGTTGTATACTCTTTGTAGGAGGTTGTAGTAAGAGGTTGTATATTTTTGGAGGTGGGCAAATGTGTTCATTTATCAGACGGCGATACTATACTTGTGTGTGTGTGTAATCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019982
ATGCAATCTTTACAACAGCCCAGTAATAGGGATTTAGAATCAGCAACTGATTCCGATAATGGCGGAGGAGGCCGCCGCCGAAGTGACGCCGGCGAGAAAGGTGCACTCGAGATTGTGGGTGTGCCGGAAAACGACAATGGTGCTGAGAAGGAGAGGAGACGATCCAGTGTGTCGGAGTGCACAGTAGAGATTGTGGATCTGGAGGTGGAAGGTGGAGCTGGGGAAACGAAGGTGCATTTGGGTAAAATTGAGAGGGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804602.1
MQSLQQPSNRDLESATDSDNGGGGRRRSDAGEKGALEIVGVPENDNGAEKERRRSSVSECTVEIVDLEVEGGAGETKVHLGKIERDCRICHLSMDATNEDSGFPIELGCSCKDDLAAAHKQCAEAWFKIKGDKTCEICGSLAQNVVGVTEAELAESWNEASDTAAVAAASSPSSQSRNFWQGRRFLNFLLACMVFAFVISWLFHFNVPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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