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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001545`

染色体: Chr04 坐标: 25568897-25570277 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001545`
名称	SmilChr04G001545
描述	uncharacterized SmilChr04G001545
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25568897 - 25570277 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023204`
GeneID	`131023204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023204`
原始查询	`SmilChr04G001545`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0106900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=57.1; qcov=0.455; evalue=1.53e-69; confidence=medium
Rice	`Os08g0106900` - identity=38.9; qcov=0.795; evalue=2.03e-71; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808729.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057808729.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057808729.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808729.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25568988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A11,A15,A3,A4,A9,B10,B117,B12,B120,B130,B136,B138,B19,B28,B31,B38,B39,B44,B46,B62,B63,B71,B75,B78,B82,B9,B93,B99,C13,C17,C19,C2,C23,C30,C31,C32,C35,C37,C45,C46,C47,C48,C53,C57,C68,C72,C74,C8,C85,C9,D7,D9
`Chr4:25568996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:25569008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B53,C84
`Chr4:25569044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B57,C11,C44,C65
`Chr4:25569049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:25569082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:25569108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B65
`Chr4:25569111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:25569124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A11,A15,A3,A4,A9,B10,B12,B130,B136,B138,B19,B28,B31,B38,B44,B46,B71,B75,B78,B9,B93,B99,C13,C17,C19,C2,C23,C30,C31,C35,C45,C46,C47,C48,C53,C57,C68,C72,C74,C8,C85,C9,D7,D9
`Chr4:25569163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B86,B94,C45
`Chr4:25569166`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A22,C52
`Chr4:25569166`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A22,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808729.1

420 aa

210

420

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

PF26138 DUF8040 71-161 aa PF01609 DDE_Tnp_1 191-322 aa PF13359 DDE_Tnp_4 217-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808729.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	71	161	7.3e-22	77.8	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057808729.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	191	322	3.9e-07	30.8	Transposase DDE domain
`XP_057808729.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	217	343	2.2e-17	63.9	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952746.1
ATGAATTATGAAGATAAAATTAAAATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAAGTGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGATCATGCTAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTTTATTGGGAAATATTATGACGCTACATCCGACTGCTGACAACTCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCGTTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023204
ATGAATTATGAAGATAAAATTAAAATTGCAATTGAAGAAGACATAGATGAAGAACTTGAGGATGAAAGTGAAACAGAGATGGAGATTGAACTTTCTGATCATGCTAGGCAACTGATGGAAGCAGCTAAGGTAGTTATCACTTTATTGGGAAATATTATGACGCTACATCCGACTGCTGACAACTCTCTGATGCGACGACCAAAGACTAGGGAAGGATTCCGTTTTATTACGAGAATGATGGATGGAGATCCGAGCCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808729.1
MNYEDKIKIAIEEDIDEELEDESETEMEIELSDHARQLMEAAKVVITLLGNIMTLHPTADNSLMRRPKTREGFRFITRMMDGDPSQFRQLYRMYPDVFIKLCQIIREKAHVDDTRYTTVEEMLATFLIIVRHNDRYCNVRERFGRSHFAASQNFNKILRALNTIAPDMMVKPTGAIPAKTRKSTRFNPYFKDCIRAIDGTHIPAMIRGRDVSCYRNRHGFIYVLSGWEGSAHDSKILSDALSRPNGLHVPQGKYFLVDCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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