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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001559`

染色体: Chr04 坐标: 25871137-25875756 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001559`
名称	SmilChr04G001559
描述	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	25871137 - 25875756 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019993`
GeneID	`131019993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019993`
原始查询	`SmilChr04G001559`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
产物	LIM domain-containing protein WLIM2b-like
Arabidopsis	`AT3G55770` (WLIM2b) GATA type zinc finger transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824743] identity=82.9; qcov=0.958; evalue=7.02e-111; confidence=high
Rice	`Os03g0266100` - identity=78.9; qcov=0.952; evalue=6.28e-102; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057804611.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057804611.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804611.1`
4	Focal adhesion	Focal adhesion	0.20000	`XP_057804611.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057804611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:25871436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A8,B104,B8,C83
`Chr4:25871542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:25873791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A8,B104,B8,C83
`Chr4:25875065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B53,B90,C42,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804611.1

189 aa

189

LIM

PF00412 LIM 10-66 aa PF00412 LIM 108-164 aa

XP_057804612.1

189 aa

189

LIM

PF00412 LIM 10-66 aa PF00412 LIM 108-164 aa

XP_057804614.1

189 aa

189

LIM

PF00412 LIM 10-66 aa PF00412 LIM 108-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804611.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	10	66	7e-25	87.8	LIM domain
`XP_057804611.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	164	7e-25	87.8	LIM domain
`XP_057804612.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	10	66	7e-25	87.8	LIM domain
`XP_057804612.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	164	7e-25	87.8	LIM domain
`XP_057804614.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	10	66	7e-25	87.8	LIM domain
`XP_057804614.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	108	164	7e-25	87.8	LIM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948631.1
GAAGAAAGAGTGCCTTTCAAAATTAAATAACCAATAATAATATTCCTTAATAATTAATAGTGCATTCTCACTAATGACTGTAATAAACCTATTTTTTAGGCTTTTAAGTAAAAGAAAAGACAGCATGTTGAGGAATATCTTCCTCTGCAGGAGTCAAAGTAGAAACTAATGCGTTTCCAGCGCAGATATTTACCATCTCTTTCTCTCTCTATCCACCATCATCATTAATCTTCATCATCTCGTGTTGCTGCATCTCTCTC...

XM_057948628.1
AAACCTATTTTTTAGGCTTTTAAGTAAAAGAAAAGACAGCATGTTGAGGAATATCTTCCTCTGCAGGAGTCAAAGTAGAAACTAATGCGTTTCCAGCGCAGATATTTACCATCTCTTTCTCTCTCTATCCACCATCATCATTAATCTTCATCATCTCGTGTTGCTGCATCTCTCTCTCTCTCTCTCGCCTGCGCGTACATAAAGAGATACAGGGTGGAGAGGCTTATCCACCAATTTTTGGATTTTCATGACTTTACATC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131019993
ATGTCTTTTATTGGGACACAACAGAAATGCAAGGCGTGTGAGAAGACTGTTTATCCGGTGGAATTGTTGTCTGCTGATGGAGTTAGTTATCACAAATCTTGCTTCAAATGTTCTCATTGCAAAGGAACCCTCAAGCTAAGCAGTTATTCGTCAATGGAGGGTGTTCTCTATTGCAAGCCTCACTATGAGCAACTTTTCAAGGAGACTGGCAGTTTCGCCAAGAACTTTCAATCACCTGCAAAGTCAGCTGAGAAGTTAAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057804611.1
MSFIGTQQKCKACEKTVYPVELLSADGVSYHKSCFKCSHCKGTLKLSSYSSMEGVLYCKPHYEQLFKETGSFAKNFQSPAKSAEKLTAEMTRSPSKAAGMFSGTQEKCATCGKTAYPLEKVTVESLSYHKSCFKCSHGGCSLTPSNYAALDGILYCKPHFSQLFKEKGSYNHLVKSASMKRPTAVVPDS

XP_057804612.1
MSFIGTQQKCKACEKTVYPVELLSADGVSYHKSCFKCSHCKGTLKLSSYSSMEGVLYCKPHYEQLFKETGSFAKNFQSPAKSAEKLTAEMTRSPSKAAGMFSGTQEKCATCGKTAYPLEKVTVESLSYHKSCFKCSHGGCSLTPSNYAALDGILYCKPHFSQLFKEKGSYNHLVKSASMKRPTAVVPDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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