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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001574`

染色体: Chr04 坐标: 26130137-26139920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001574`
名称	SmilChr04G001574
描述	uncharacterized SmilChr04G001574
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26130137 - 26139920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023211`
GeneID	`131023211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023211`
原始查询	`SmilChr04G001574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0646700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=35.2; qcov=0.134; evalue=3.39e-10; confidence=weak
Rice	`Os01g0646700` - identity=39; qcov=0.276; evalue=8.9e-34; confidence=weak
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808736.1`
2	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057808736.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808736.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808736.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26130138`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B22
`Chr4:26130138`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B22
`Chr4:26130144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr4:26130144`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr4:26130156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B66,C58,C87
`Chr4:26130169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,A8,B137,C64,C82
`Chr4:26130225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C85
`Chr4:26130251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B22,C13
`Chr4:26130291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C19,D7
`Chr4:26130305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr4:26130320`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr4:26130341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C61,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808736.1

677 aa

338

677

Helitron_like_N

PIF1

PF14214 Helitron_like_N 1-88 aa PF05970 PIF1 480-618 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808736.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	1	88	1.7e-34	120.4	Helitron helicase-like domain at N-terminus
`XP_057808736.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	480	618	3.5e-52	177.9	PIF1-like helicase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952753.1
ATGGCTATATGTAAATGGATTGGATATCCTAATCTATTCATCACATTTACATGTAATCCAAAGTGGCCTGAGATTGTTAGATATGTTGAAAAACGAGGATTGAAACCGGAAGATCGCCCTGATATTATTTGTCGGGTTTTCAAAATGAAGTTGAATAATTTGATTAATGATCTATGTAAAGAGAAAATATTCGGCATTGTGAGAGCAGTTGTATACACTATTGAATTTCAAAAAAGAGGACTTCCACATGCACATATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023211
ATGGCTATATGTAAATGGATTGGATATCCTAATCTATTCATCACATTTACATGTAATCCAAAGTGGCCTGAGATTGTTAGATATGTTGAAAAACGAGGATTGAAACCGGAAGATCGCCCTGATATTATTTGTCGGGTTTTCAAAATGAAGTTGAATAATTTGATTAATGATCTATGTAAAGAGAAAATATTCGGCATTGTGAGAGCAGTTGTATACACTATTGAATTTCAAAAAAGAGGACTTCCACATGCACATATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808736.1
MAICKWIGYPNLFITFTCNPKWPEIVRYVEKRGLKPEDRPDIICRVFKMKLNNLINDLCKEKIFGIVRAVVYTIEFQKRGLPHAHILLFFWNEDRNPSPDNINEIISAEIPDMDLDPKYYTAVHDFMLHGPCGVANKNSSCMANGRCTKYFPKKYVETTSVDEDGYPVYRRRNNGRTILKNGVPLDNRYVVPHNRYLLMKYGAHINVEWCNQSRSIKYLFKYINKGNDRVTASFYKSTDDGHMEKNVDEVNMYYDCRYIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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