当前解析结果
SmilChr04G001577| 统一新 Gene ID | SmilChr04G001577 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G001577 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G001577 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 26204702 - 26205620 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023213 |
|---|---|
| GeneID | 131023213 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023213 |
| 原始查询 | SmilChr04G001577 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=36.3; qcov=0.389; evalue=3.77e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023213 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808737.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057808737.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057808737.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808737.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808737.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:26204730 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,C13 |
Chr4:26204732 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B33,B46,B55,C23 |
Chr4:26204753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B12,B55,C64,D10 |
Chr4:26204761 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B71,C66,D4 |
Chr4:26204772 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A18,B100,B129,B13,B61,B67,B72,C11,C29,C5,C69 |
Chr4:26204775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr4:26204802 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B46,B55,C23 |
Chr4:26204836 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A16,B99 |
Chr4:26204857 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr4:26204873 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C23 |
Chr4:26204916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B53,C42 |
Chr4:26204917 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。