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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G001578`

染色体: Chr04 坐标: 26208374-26209459 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G001578`
名称	SmilChr04G001578
描述	uncharacterized SmilChr04G001578
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	26208374 - 26209459 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023214`
GeneID	`131023214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023214`
原始查询	`SmilChr04G001578`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0458700; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os10g0458700; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0458700` - identity=34.5; qcov=0.241; evalue=2.68e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057808738.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057808738.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057808738.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808738.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:26208400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B65,B9,C67,C78
`Chr4:26208406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:26208419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B31,B9,C37,C67,D11
`Chr4:26208428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A13,A16,A7,B112,B122,B126,B2,B27,B38,B43,B51,B58,B65,B66,B91,C13,C14,C70
`Chr4:26208441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:26208445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B30,B96,C10
`Chr4:26208454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B36,B65,C78
`Chr4:26208456`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A15,B131,B133,B137,B16,B24,B32,B6,B62,B86,C25,C34,C63,C64,C66
`Chr4:26208487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C37
`Chr4:26208492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B115,B53,C42
`Chr4:26208492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C42
`Chr4:26208505`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B102,B112,B124,B15,B38,C55,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808738.1

361 aa

180

361

RVT_3

Integrase_H2C2

PF13456 RVT_3 92-199 aa PF17921 Integrase_H2C2 291-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808738.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	92	199	1.5e-14	54.7	Reverse transcriptase-like
`XP_057808738.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	291	339	3.5e-10	40.6	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952755.1
ATGGTCACAGCTCGGAAGCTAAGACCCTATTTCTTGTCACACCACGTGGTGGTTCGAACTGCCTTACCTTTCAAACAAGTGCTGGGGAGGCCAGATCTTTCAGGACACATGGTGAAATGGGCCGTGGAGTTAGGGGAATATGATGTGGATTATGAGCCAAGGATGGCTATTAAGGTCCAAGCCCTTGCGGATTTTATTCAAGAAACTACTCGTCGCCCTGTACAAGAGTTTTGGGTGGCTTTCGTGGATGGATTGGTTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023214
ATGGTCACAGCTCGGAAGCTAAGACCCTATTTCTTGTCACACCACGTGGTGGTTCGAACTGCCTTACCTTTCAAACAAGTGCTGGGGAGGCCAGATCTTTCAGGACACATGGTGAAATGGGCCGTGGAGTTAGGGGAATATGATGTGGATTATGAGCCAAGGATGGCTATTAAGGTCCAAGCCCTTGCGGATTTTATTCAAGAAACTACTCGTCGCCCTGTACAAGAGTTTTGGGTGGCTTTCGTGGATGGATTGGTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808738.1
MVTARKLRPYFLSHHVVVRTALPFKQVLGRPDLSGHMVKWAVELGEYDVDYEPRMAIKVQALADFIQETTRRPVQEFWVAFVDGLVTKEGCGIGVYIISPGSEVFQFAIKFTCKISNNEAEYEGVVRAAHILSELRAECVIIRTDSQLVAQQLSGGYHIKEDRMRAYHSKIVELKKKFVEFRIEQISREENTRADLLARVASVVEQTWNDEITLLCDTREMRTSQVFAVEIRDDWRAPIIHFLITGERLSRESNQRARYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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